荧光定量PCR技术在临床微生物检测中的应用价值
2020-04-11蒋雪纷
蒋雪纷
(新疆伊犁州友谊医院检验科,新疆 伊犁 835000)
荧光定量PCR技术是一种在PCR反应体系中加入荧光基因,使荧光信号通过累积,实现对整个PCR过程的实时监测,达到增强灵敏度,提高监测效率,精准定量检测的效果[1-2]。为探究荧光定量PCR,技术在临床微生物检测中的应用效果,本次研究回顾性分析我院门诊收治的90例患者的临床标本,对其荧光定量PCR技术微生物检测结果进行分析,详见下文描述。
1 资料与方法
1.1 一般资料 回顾性分析2017年1月-2019年1月间我院门诊收治的90例患者的临床标本,患者中有男45例,女35例,年龄20-75岁,平均(44.28±5.36)岁;病情:泌尿系统感染患者10例,细菌性食物中毒患者6例,上呼吸道感染患者37例,流行性感冒患者27例,肾盂肾炎患者7例,慢性阻塞性肺病患者3例;90份临床标本中粪便标本51份,尿液标本39份。
1.2 方法 患者标本均采用荧光定量PCR技术检测,将样本增菌液(1.5 mL)滴入灭菌Epp管中,震荡均匀,置入高速离心机内进行2 min离心操作,再彻底分离上层清液,加入μL DNA提取液于余下沉淀中,充分摇匀,沸水浴10 min,再置入高速离心机离心操作5 min,去除4 μg上层清液,完成PCR反应,结束后对标本进行扩增检测,操作与检测均严格按照试剂盒说明书进行。
2 结果
2.1 粪便标本与尿液标本中微生物检测结果 粪便标本共51份,其中有15株沙门氏菌被检出,阳性率33.33%,有2株肠出血性大肠杆菌0157:H7被检出,阳性率3.92%,10株副溶血性弧菌被检出,阳性率19.61%;尿液标本共39份,其中有4份金黄色葡萄球菌被检出,阳性率10.26%,见表1。
表1 粪便标本与尿液标本中微生物检测结果
2.2 粪便标本与尿液标本中微生物特异性检测结果 各取2株沙门氏菌、肠出血性大肠杆菌0157:H7、副溶血性弧菌及黄色葡萄球菌进行试剂盒特异性检测,结果未出现假阳性或假阴性情况,特异性100%;同时对所取菌株进行10倍系列系数PCR技术灵敏度检测,结果表明102拷贝/mL核酸样本能够进行最低核酸检测限度。
3 讨论
荧光定量PCR(fluorescent quantitative PCR)技术,是指利用荧光基团加入PCR反应体系中,通过荧光信号的累积对整个PCR的进程进行实时监测,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的检测方法[3]。该技术最早出现于上个世纪90年代的美国,其研究人员通过实时监控整个PCR过程,对起始模板浓度进行了专一、快速、灵敏以及可重复性的精确定量检测,从而开始PCR技术的高速发展时期,随着PCR技术在临床中的应用越来越广泛[4],其独特的优势得到了广大研究人员的认可与青睐,其中,PCR技术在临床检测与鉴定中的应用主要包括以下几块:
3.1 PCR技术在病毒检测中的应用 目前,PCR技术在多种病毒的临床检测中得到了应用,例如有研究人员通过四重TaqMan荧光定量PCR技术对185份不同基因混合到一起的B型肝炎样本进行检测,结果显示该方法能够对所有基因型进行检测,从而对PCR技术的高精准度进行的验证[5];此外,还有研究人员收集了临床172份手足口病患者的324份标本,针对人肠道病毒、柯萨奇病毒A组16型病毒以及肠道病毒EV71型核酸特异性的反转录检测,同时再对上述标本进行荧光定量PCR以及ELISA法检测,结果显示,与反转录检测相比,只有反转录检测方法检测结果与其相近,同时反转录检测与反转录检测灵敏度均高于ELISA检测,由此可以印证荧光定量PCR检测具有高效快捷、特异性强、灵敏度高的优势。
3.2 PCR技术在细菌检测中的应用 近年来,随着传统检测方法对细菌检测与鉴别的缺陷逐渐显露,PCR技术用于临床细菌检测的优势也在逐渐显现。有研究人员利用PCR技术创新了一种分枝杆菌的结合检测方法,并利用该方法对细菌进行了检测测试,与传统涂片染色法及培养法相比,其灵敏度与与特异性分别达到了97.2%与100%,明显超过了传统方法。此外还有研究人员利用双重PCR技术对鼠伤韩沙门菌与肠炎门菌进行检测,结果显示,双重PCR技术检测灵敏度与特异性均为100%,而检测时间较传统检测方法的4-5 d大大缩短,约为8h即可完成检测,大大提高了临床检测的效率,有助于患者的早期治疗,该方法可期待其在未来临床检测中的推广应用;还有研究人员采用分组法将230例无症状者咽拭子标本进行TaqManMGB探针荧光定量PCR法、常规PCR法与常规分离培养法进行检测,检测细菌为脑膜炎奈瑟球菌,结果显示,上述三种方法的阳性检出率分别为10.43%、6.52%以及3.48%,也验证了TaqManMGB探针荧光定量PCR法对于细菌的检出率均高于常规PCR法与常规分离培养法。
3.3 PCR技术在真菌检测中的应用 临床中关于荧光定量PCR检测方法在真菌检测中的应用均有报道。其中有研究人员通过对曲霉菌的18SRNA序列设计引物及探针对临床疑似标本进行检测,结果显示特异性高达100%;有研究人员通过荧光定量PCR方法对异基因造血干细胞移植后侵袭性曲霉菌感染(IA)进行了早期诊断中的评价,结果显示该检测方法敏感性与特异性高达94.4%与100%。
结合本次研究结果:各取2株沙门氏菌、肠出血性大肠杆菌0157:H7、副溶血性弧菌及黄色葡萄球菌进行试剂盒特异性检测,结果未出现假阳性或假阴性情况,特异性100%;同时对所取菌株进行10倍系列系数PCR技术灵敏度检测,结果表明102拷贝/mL核酸样本能够进行最低核酸检测限度。
综上,在微生物的临床检测中,荧光定量PCR技术灵敏度强,特异性好,检测效率高,还具有精准缺量的特点,值得推广应用。