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聚合酶链式反应分析仪(PCR仪)校准装置的研究与设计

2019-11-28陈海凌

质量技术监督研究 2019年5期
关键词:寄存器温度传感器分析仪

魏 群,吕 丹,陈海凌

(1 福建省计量科学研究院,福建 福州 350003)

(2 人民解放军91370部队,福建 福州 350015)

1 概述

聚合酶链式反应分析仪(Polymerase Chain Reaction Analyzer,简称“PCR仪”)可提供制定的温度场,在该环境下DNA聚合酶发生复制进行扩增[1]。PCR技术具有极高的检测灵敏度和特异性,可广泛用于临床医学等的诊断和疗效观察,在器官移植的基因配型上作用是难以替代的。目前市场上的PCR仪有梯度PCR仪、实时荧光定量PCR仪、原位PCR仪和定性PCR仪等。常规的多通道温度检测方法,比如带热电偶或带热电阻传感器的温度巡检仪,在(0~100)℃测温范围内的最大示值误差能达到±0.3℃。但此类测温仪器由于传感器的结构与扩增仪孔板不能完全紧密接触,导致测温结果的准确度不能满足校准要求[2]。

目前,国内对聚合酶链式反应分析仪的温度计量还处于起步阶段,国内市场上的专业聚合酶链式反应分析仪温度校准装置还是空白,各计量检测单位多采用温度巡检仪或国外的检测系统,如荷兰Driftcon公司的无线PCR仪温度校验系统和美国OPULUS公司的温度巡回检测装置等。这些检测装置也存在一些问题。

(1)现有装置所配置的传感器只可适用于固定形状的PCR仪,或通道数固定,无法满足各类PCR仪的多样校准需求。

(2)某些装置是采用传统的温度巡回检测方法来实现温度测量,多通道测量时每通道的数据采样时间长,无法反应PCR仪的实时温度,也就无法实现温度超调和升降温速率的功能。

(3)价格昂贵,国外设备多在(30-40)万/套。

2 PCR仪自动校准装置的设计需求

2015年,原国家质检总局正式发布了JJF 1527-2015《聚合酶链反应分析仪校准规范》[3],该规范推荐了使用的测温点布置方式(15点校准与位置分布,如图1所示)、校准设备和标准物质、软件温控程序数据读取的基本顺序、误差计算与校准结果表达方式等。

图1 15点校准位置布点

因此,根据JJF 1527-2015《聚合酶链反应分析仪校准规范》和PCR仪校准装置的存在问题,文中认为可以从以下三方面进行方案改进。

(1)设计一套专用自动化装置,配置触摸屏,支持至少15通道的高精度温度传感器的实时显示和记录、分析、处理;

(2)信号高速传输,每路数据采样频率大于2次/秒;

(3)设计一套自动校准软件系统,包括数据采集、数据处理和数据报表等功能,数据采集将终端数据采集至上位机,数据处理包括温度示值误差、温度均匀性、升降温速率等,数据报表包括聚合酶链反应分析仪校准原始记录的所有内容。

3 PCR仪自动校准装置的设计

PCR仪自动校准装置需采集多路温度传感器信号,显示并处理相关数据,总体框架如图2所示。多路温度传感器采用热敏电阻,采集PCR仪不同位置反应孔的温度信号,由片通电路实现各传感器的选通,每个传感器采样速率不小于2次/秒;温度信号经过信号转换模块由电阻信号转换为电压信号,并经过A/D转换进入MCU处理;MCU在触摸屏显示实时数据以及处理结果等,并可通过外扩输出数据;由按键控制装置的开启与关闭;由电源模块为传感器、MCU、触摸屏、外扩等供电,其未在图中画出;测试完成后,可由外扩设备将数据发至上位机软件进行数据处理等。

图2 硬件框架图

3.1 微处理器MCU

微处理器采用意法STM32F4系列,具有如下优点:集成ARM Cortex-M4内核,主频180MHz,高达2MB的片上双库Flash存储器,具有突出的高性能、高速数据传输能力和丰富的外部器件扩展和通信总线,以及杰出的能耗效率,适用于电池供电情况。

3.2 温度传感器

温度传感器采用热敏电阻,具有体积小、灵敏度高、反应速度快、分辨率高等优点,其缺点在于非线性,而文中采用的核心控制芯片提供大容量的数据存储空间,可完整记录该温度-阻值对应表,因此选择热敏电阻作为测温元件。

3.3 片选模块

利用移位寄存器74HC595级联电路来实现传感器选通设计,如图3所示。74HC595是一个8位串行输入、可串行或并行输出的移位寄存器存储寄存器和三态输出。该设备具有串行输入(DS)和串行输出(Q7)来级联和异步复位输入的功能。在移位寄存器时钟(SHCP)上升沿时,DS上的数据会被移入移位寄存器,在存储寄存器时钟(STCP)上升沿时,移位寄存器里的数据传输到存储寄存器,当输出使能OE为低时,存储寄存器里的数据就会并行输出。

图3 片选电路

3.4 外扩模块

文中数据外扩采用WiFi和USB两种模式。

WiFi利用ESP-12F WiFi模块实现,该模块支持标准的IEEE802.11 b/g/n协议,完整的 TCP/IP协议栈。用户可以使用该模块为现有的设备添加联网功能,也可以构建独立的网络控制器。内置Tensilica L106超低功耗32位微型MCU,主频支持80MHz和160MHz,支持RTOS。深度睡眠保持电流为10uA,关断电流小于5uA,2ms之内唤醒、连接并传递数据包。待机状态消耗功率小于1.0mW。电路连接图如图4所示。

图4 WiFi电路连接图

另设USB输出,电路如图5所示。

图5 15 USB输出电路

3.5 自动校准软件

校准数据可通过外扩设备发至上位机软件进行数据处理等,软件界面如图6所示,用彩色线条描绘多通道温度实时数据,直观反映被校PCR仪的实时波动情况。

图6 软件界面

4 试验验证

文中采用PCR仪自动检定装置校准某品牌PCR仪,根据JJF 1527-2015《聚合酶链反应分析仪校准规范》设置采样点和升降温程序等,测量结果如表1所示,测试结果符合预期。

表1 测试结果

5 结论

目前PCR仪检定过程中存在一些问题:数据采样时间长,传感器无法准确反应PCR仪实际工作情况;价格昂贵且模式固定,无论从价格还是实用性两方面都不适用于国内现有的PCR仪校准。因此,文中针对这些存在的问题提出PCR仪校准装置的设计方案,并介绍了硬件实施方案,通过试验验证可以发现该装置的设计符合预期。

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