江苏省主栽油菜品种根肿病抗性鉴定及分子标记检测
2019-08-21彭琦张椿雨费维新
彭琦 张椿雨 费维新
摘要:在安徽省休宁县田间病圃内,利用根肿菌4号生理小种,对江苏省主栽的30个油菜品种进行根肿病抗性鉴定。同时,利用已报道的与抗4号生理小种位点PbBa8.1紧密连锁的分子标记A08-300对这30个品种进行分子检测。结果显示,30个品种的病情指数均在47及以上,都属于感病或高感品种。此外,分子检测结果表明,这30个品种中都不含有抗根肿菌4号生理小种的分子标记。目前江苏省主栽油菜品种中没有抗根肿病品种,各品种极易受到根肿菌的侵染,应引起生产者和育种者的高度重视。
关键词:江苏省;油菜;根肿病;抗性鉴定;分子标记
中图分類号: S435.654 文献标志码: A 文章编号:1002-1302(2019)12-0149-03
根肿病是由芸薹根肿菌(Plasmodiophora brassicae Woronin)侵染引起的一种重要土传病害,它主要在十字花科植物间进行传播。根肿病最早发现于地中海西岸和欧洲南部,现在全世界均有分布,尤以温带地区发生较严重[1]。根肿病的蔓延速度很快,在澳大利亚的每个州根肿病都已上升为严重的病害问题;在加拿大阿尔伯特省2003年仅仅发现 800 hm2 的油菜地感染根肿病,到2010年就有3.5万hm2土地受到根肿病菌的侵染,其中严重发病地块油菜产量损失达到30%以上,有的田块甚至造成绝收[2]。由于该病原菌在土壤中可以存活10年以上,并借助农业机械跨区作业、风媒、水媒以及种子等途径进行传播。近年来,在我国长江流域冬油菜主要产区,油菜根肿病发生危害逐年加重,尤其是在我国四川、云南、湖北及安徽等地,油菜根肿病危害严重[3-4],仅四川省发病面积就已超过20万hm2。江苏省局部地区已在油菜和其他十字花科蔬菜上发现根肿病,并存在扩展趋势。江苏省属于长江下游油菜主产区,油菜的常年种植面积在30万hm2以上,因此开展油菜品种抗根肿病的评价与鉴定对江苏省油菜产业的发展具有重要的科学意义与应用价值。
本研究拟对江苏地区主要栽种的30个油菜品种进行田间根肿病抗性鉴定,同时利用已报道的与抗4号生理小种位点PbBa8.1紧密连锁的分子标记A08-300[5]对这30个品种进行分子检测,以期了解江苏省目前主栽油菜品种抗根肿病现状,并为江苏省抗病油菜品种选育提供理论依据。
1 材料与方法
1.1 材料
30个油菜品种均保存于江苏省农业科学院种质资源圃,含江苏品种16个、安徽品种2个、浙江品种2个、上海品种2个、湖北品种1个、上游区品种4个、黄淮区品种2个和加拿大品种1个;病圃鉴定感病对照中核杂488和抗病对照F4010-4由安徽省农业科学院费维新课题组提供;分子标记检测抗病品种ZHE-226由华中农业大学张椿雨课题组提供。
1.2 油菜品种病圃(根肿菌4号小种)的鉴定
2015年,品种鉴定试验安排在安徽休宁根肿病鉴定试验病圃,病圃生理小种经Williams系统鉴定为4号小种。品种共30份,感病对照为中核杂488,抗病对照为F4010-4。1个品种种5行,1行20株苗,行宽2 m,3次重复,按照随机区组排列。油菜出苗后1周可在水沟灌溉1次保持田间有充足的水分。油菜苗期保持病圃土壤的含水量充足,以保证油菜根肿病的发病稳定性。出苗90 d后,拔出植株,洗净根部的泥土,调查记载油菜根肿病的发病情况。调查标准采用0~3级来分级,苗期油菜根肿病分级标准如下:0级为根部无病;1级为根部有细小肿瘤,体积少于根的1/3;2级为根部有中等肿瘤,体积是根的1/3~2/3;3级为根部有异常大肿瘤,体积超过根的2/3[6]。分别计算病株率及病情指数:
病株率=发病株数/调查总株数×100%;
病情指数=∑(病株数×相应病害级别)/(调查总株 数× 最高级别)×100;
校正系数K=50/对照品种的实际病情指数;
相对病情指数=K×鉴定材料的病情指数。
品种资源的抗病性差异根据相对病情指数进行分类:免疫(I)=0;0<高抗(HR)≤5;5<抗病(R)≤10;10<中抗(MR)≤20;20<中感(MS)≤30;30<感病(S)≤50;50<高感(HS)≤100[7]。
1.3 分子标记检测
合成InDel(碱基缺失标记)A08-300标记引物[5],引物序列如下:
正向引物(Rcr4F):5′-GTAGTGCGGGCCACAAAAT-3′;
反向引物(Rcr4R):5′-CACAATGGAGTGTTGAAATTCACT-3′。
利用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法提取30个主栽品种及华农抗病品种ZHE-226幼嫩叶片DNA,10 μL的PCR反应体系为0.5 μL DNA模板,正向/反向引物(10 μmol/L)各0.2 μL,0.5 μL dNTP(0.25 nmol/L),1 μL Taq酶,加H2O补齐到10 μL。PCR反应条件为:94 ℃预变性4 min;94 ℃变性40 s,55 ℃退火40 s,72 ℃延伸30 s,35个循环;72 ℃延伸10 min,结束后10 ℃保存。PCR产物在6%变性聚丙烯酰胺中进行凝胶电泳,银染显影。
2 结果与分析
2.1 油菜品种病圃(根肿菌4号小种)的鉴定评价结果
2015年在安徽休宁病圃鉴定了江苏主栽品种及资源材料30份,鉴定结果表明,这30份材料对安徽休宁的根肿病4号小种都不具有抗性。由表1可知,田间病圃鉴定根肿病病株率为57%~100%;病情指数为47~100。相对病情指数分析结果表明,30个品种中有13个品种对根肿菌4号小种感病(S),其他17个品种都达到了高感(HS)。
2.2 抗性标记检测结果
聚丙烯酰胺凝胶电泳结果(图1)表明,利用InDel标记A08-300引物进行分子标记检测时,抗病对照目的片段序列比待检测品种的目的片段都要小,也就是说待检测的30个品种中都不含有抗根肿菌4号生理小种的分子标记。
2.3 抗性标记测序结果
为了更直观看出分子标记的序列差异,笔者对抗病品种和感病品种的A08-300标记的测序结果进行比对分析(图2)。结果发现,抗性标记序列全长132 bp,而在感病品种中的标记序列长度为139 bp。差异序列位于49 bp处,抗性标记缺失了7个碱基,即CTGTTGC。
3 讨论与结论
根肿病是近年来从欧洲、澳洲、加拿大等地迅速蔓延至我国的一种非常严重的十字花科植物病害,已经严重影响到我国大部分地区油菜产业的发展。江苏省地处长江下游,是我国油菜的重要产区之一。与之相邻的安徽、浙江省均已有了对油菜根肿病的大量报道。因此,了解江苏地区现有油菜品种的根肿病抗性将有助于应对根肿病的蔓延。
我国目前发现的油菜根肿菌生理小种类型主要有2、4、5、7、9、13号6种[1,8-9]。其中,以4号生理小种存在的范围最广,造成的危害最大。在Williams鉴定系统中,4个鉴别寄主对4号生理小种均表现为感病。因此,在本研究中主要利用4号小种来鉴定江苏油菜主栽品种的根肿病抗性。遗憾的是,病圃鉴定结果表明,江苏目前的栽培种都不具备对根肿菌4号生理小种的抗性,大部分品种甚至对根肿菌高感病,说明应当加快开展抗根肿病油菜品种选育。
目前,战宗祥等通过种间杂交和分子标记辅助选择,已经在国内率先育成一系列抗根肿病油菜新品系和品种,并已开发了相关分子标记[5]。为了将这些抗病材料用于江苏等地区抗根肿病油菜品种改良,本研究首先对江苏油菜品种进行分子标记检测,结果发现江苏品种不具备根肿病抗性的原因在于不含有相关抗性分子标记。通过杂交,可以使江苏的品种带上抗性标记,而通过分子标记辅助选择则可以加快育种进程。为此,本研究对抗性标记进行测序和序列比对分析,并发现抗性标记序列缺少了7个碱基。研究结果将有助于开发新的标记用于油菜根肿病抗性品种选育。
参考文献:
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