国内猪丁型冠状病毒的感染状况汇总(2012—2017 年)
2019-08-06徐国栋王磊
徐国栋,王磊
(天津市动物疫病预防控制中心 天津 300402)
国内新生仔猪腹泻是近10 年来导致仔猪成活率偏低的最主要原因之一[1,2]。在对腹泻原因的探究中,流行性腹泻成为最受业界关注的病因[2],但免疫后仍不能有效控制新生仔猪剧烈腹泻的情况时有发生,因此认为除疫苗免疫效果不理想外,仍可能存在其它潜在致病因子[3,4]。在众多被关注的致腹泻病原中包括猪丁型冠状病毒(Porcine detla coronavirus,PDCoV,又称猪德尔塔冠状病毒),2014 年2 月11 日美国学者曾自腹泻猪粪便和小肠样品中检测到PDCoV[5],2015 年贺东生等[6]首次在国内患严重腹泻的新生仔猪小肠病料中检测到PDCoV,且有证据显示2004 年前国内不同地区的猪群中就有PDCoV 存在[7]。为了解国内猪群中PDCoV 的整体感染状况,笔者对相关调查文献进行了汇总。
1 汇总方法
查阅PDCoV 的相关调查文献,剔除内容重复的文献,按时间顺序依次录入被检样品相关信息,包括采样时间、地点、猪群是否腹泻、样品种类、检测方法、样品阳性结果。
用Excel 工作表对原始数据进行汇总统计。
2 汇总结果
2.1 原始数据汇总结果
汇总结果见表1、2,特殊符号代表意义如下:①采样时间栏中,凡标记“*”的是将文献投稿时间(或发表时间)假定为采样时间。②地点栏中,Ad1:江苏、湖南、河南、浙江、江西、河北、安徽、黑龙江、山东和上海;Ad2:陕西、广东和湖北;Ad3:天津和河北。汇总的病原学、血清学原始调查数据分别见表1 和2。
2.1.2 病原学汇总结果
共对7 篇文献所载病原学调查数据进行了汇总,调查者应用不同的核酸检测方法对PDCoV M 基因、N 基因等进行了检测,被检样品来自江苏、湖南、河南、浙江、江西、河北、安徽、黑龙江、山东、上海、陕西、广东、湖北、天津、广西共15 个省(市)猪群,取自腹泻猪群的样品占全部样品的95.42%(1,333/1,397),样品种类全部为粪便或小肠,累计检测1,397 份,阳性数224 份,阳性率区间为4.33%~33.71%,平均阳性率为16.03%。
2.1.2 血清学汇总结果
共对3 篇文献所载血清学调查数据进行了汇总,调查者应用ELISA 方法对PDCoV M 蛋白、N 蛋白或S1 蛋白血清抗体进行了检测,血清
采自江苏、湖南、河南、浙江、江西、河北、安徽、黑龙江、山东和上海等省(市)的腹泻或非腹泻猪群,累计检测血清1,028份,阳性数355 份,阳性率区间为3.3%~54.05%,平均阳性率为34.53%。
表1 PDCoV 病原学检测汇总表
表2 PDCoV 血清学检测汇总表
2.2 不同时间节点样品阳性结果汇总
若针对同一时间节点内样品检测数据进行累加,可得到“时间-阳性率”相关数据,其中病原学调查数据中,因“2012—2015*”的时间节点跨度较大,未列入被累加数据。由此可以得到:2014—2015、2015、2016、2016—2017 和2017 年病原学检测合并后的阳性率分别为9.84%(25/254)、11.81%(15/127)、6.01%(28/466)、16.92%(22/130) 和28.13%(18/64),平 均 阳 性 率 为10.38%(108/1,041);2014、2014—2015、2015、2015—2016 和2016 年血清学检测结果合并后的阳性率分别为50%(13/26)、11.60%(37/319)、43.24%(16/37)、44.17%(269/609) 和54.05%(20/37), 平 均 阳 性 率 为34.53%(355/1,028)。
可以看出:①在不同时间节点中,病原学检测的阳性率在6.01%~28.13%,平均阳性率为10.38%。②在不同时间节点中,血清学检测的阳性率在11.6%~54.05%,平均阳性率为34.53%。③血清学检测的平均阳性率明显高于病原学检测的平均阳性率。④以时间为序的病原学和血清学阳性率总体上均呈缓慢升高趋势。
3 结论
PDCoV 是套式病毒目、冠状病毒科、冠状病毒亚科成员,该病毒可以感染猪小肠组织的任何肠段,尤其是空肠和回肠。对国内调查文献汇总后得出:①关于国内猪群中PDCoV 的调查文献偏少,未见有针对某一特定猪亚群(如发生剧烈腹泻哺乳仔猪群)的大样本调查。同时,所涉及的采样省份及其频次均偏少,期望今后能有较系统的调查报告。②PDCoV 病原学检测阳性率区间为4.33%~33.71%,血清学检测抗体阳性率区间为3.3%~54.05%,阳性率数值区域的跨度均较大,暗示国内猪群中PDCoV 的感染率并不均一。③血清学平均阳性率(34.53%)明显高于病原学平均阳性率(10.38%),因此尽管病原学检测样品多源于腹泻猪群,仍推测调查期间国内猪群中PDCoV 的实际感染率应高于10.38%。④以时间为序的病原学和血清学阳性率均呈现缓慢升高趋势,提示国内猪群中PDCoV 的感染率有随时间变化升高的趋势。