长链非编码RNA—LINC01772对肝细胞肝癌预后的影响
2019-05-16袁新王锃涵余祖江
袁新 王锃涵 余祖江
【摘要】 目的: 分析长链非编码RNA(lncRNA) LINC01772及肝细胞肝癌临床相关指标与预后的相关性,以期为改善肝细胞肝癌患者的临床结局,延长生存期提供新的思路。 方法: 从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中下载有关HCC的基因组学数据和研究个体的临床资料,并利用SPSS软件比较分析不同LINC01772的表达量以及HCC患者的年龄、性别、TNM分期、血清AFP浓度、病例分级等临床特性对HCC患者预后情况的影响。 结果: HCC癌组织的TNM分期及LINC01772的表达量与患者的无进展生存期(Progress Free Survival,PFS)存在显著相关性(P<0.05)。 结论: LINC01772与HCC的发生发展相关,有望成为HCC预测预后的潜在生物学标志物。
【关键词】 长非编码RNA-LINC01772;肝细胞肝癌;癌症基因组图谱;患者预后
【中图分类号】R730.3 【文献标识码】A 【文章编号】2095-6851(2019)05-220-01
肝癌是与癌症相关的死亡最常见的原因之一[1]。肝细胞肝癌(Hepatocellular Carcinoma,HCC)占所有肝癌病例的70%~90%。虽然我国HCC的发病率和死亡率有明显下降的趋势,但是庞大的人口基数和快速的人口增长仍然导致大量新的HCC病例[2]。长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)是长度超过200个核苷酸的转录本,没有蛋白质编码能力。长基因间非编码RNA(lincRNAs)是长非编码RNA(lncRNA)的亚型,其参与了发育、分化和致癌等多种生物学过程[3]。LINC01772是lincRNA的一种,在HCC中的具体机制和作用尚待阐明。本研究旨在通过TCGA数据库探究LINC01772与HCC预后的关系,探讨其是否可以成为预测肝细胞肝癌无进展生存期的指标。
1 资料与方法
1.1 一般资料
在TCGA数据库中选取肝细胞肝癌的高通量测序表达谱数据,数据时间截止至2017年7月。运用R软件对数据进行整理,剔除基因表达情况、一般资料、临床病理特征或预后情况不完整的个体资料,得到具有完整数据的病例345例(包含30例配对的癌旁组织的数据)。
1.2 方法
1.2.1 数据库分类
依据研究对象的年龄、性别、TNM分期、血清AFP浓度及病理学分级等资料的不同等级进行分类预处理。根据LINC01772的中位表达量将HCC癌组织分为高表达组和低表达组。
1.2.2 统计分析
使用SPSS23.0软件对数据进行统计学分析。采用单因素多因素COX回归模型分析LINC01772表达水平与HCC患者预后的关系。以a=0.05为检验水准,P<0.05为差异有统计学意义。
2 结果
LINC01772表达水平与HCC患者预后情况的相关性
取HCC患者的年龄、性别、TNM分期、血清AFP浓度、病理学分级和LINC01772表达水平为协变量进行Kaplan-Meier生存分析。结果显示,LINC01772高水平表達的HCC患者的PFS显著低于LINC01772低水平表达者(P<0.05)。采用单变量COX回归模型和多变量COX回归模型分析各种临床参数在生存率中的价值,单因素分析结果显示TNM分期以及LINC01772的表达与患者PFS显著相关(P<0.05);此外,取HCC患者的TNM分期和LIN01772表达水平为协变量进行对因素回归分析,TNM分期与LINC01772表达水平均为HCC的独立危险因素,详见表1。
3 讨论
肝细胞肝癌(HCC)已成为中国癌症相关死亡的第二大原因[4]。虽然在诊断和手术治疗方面取得了很大进展,但复发率和转移率仍然很高。此外,HCC患者通常在中晚期阶段被初步诊断,HCC晚期疾病患者的预后仍未得到保证[5]。因此,积极探索HCC分子机制,寻找影响肝癌预后的相关因素,对延长患者生存期,进一步制定诊疗计划有着重要的作用。
研究表明,长链非编码RNA(lncRNA)是地址代码的关键组成部分,允许将基因、染色体和蛋白质复合物运输到其目的地,但需要激活或停用[6]。lncRNA与肿瘤发生发展密切相关 ,可作为许多人类恶性肿瘤的潜在诊断和预后生物标志物,包括肺癌[7]、乳腺癌[8]和结肠癌[9]。源自某些基因的基因间区域的lincRNA起着竞争性内源RNA的作用并隔离miRNA,靶向染色质修饰复合物或RNA结合蛋白以改变基因表达。LINC01772是一种新发现的lncRNA,有学者报到了其在肝癌中的表达及临床意义,但其对HCC的预后影响尚不清楚[10]。
本研究通过挖掘TCGA数据库中有关LINC01772在HCC和癌旁组织中的信息,推断LINC01772对HCC患者预后的影响,得出了HCC癌组织的TNM分期及LINC01772的表达量与患者的无进展生存期(Progress Free Survival,PFS)存在显著相关性(P<0.05)的结论,证实了LINC01772具有判断肝细胞肝癌预后情况的参考价值。
参考文献:
[1] Bray F, Ferlay J, Soerjomataram I, Siegel RL, Torre LA, Jemal A. Global cancer statistics 2018: GLOBOCAN estimates of incidence and mortality worldwide for 36 cancers in 185 countries. CA Cancer J Clin. 2018;68:394–424.
[2] Omata M, Cheng A L, Kokudo N, et al. Asia-Pacific clinical practice guidelines on the management of hepatocellular carcinoma: a 2017 update[J]. Hepatology International, 2017, 11(4):1-54.
[3] Shen P, Pichler M, Chen M, et al. To Wnt or Lose: The Missing Non-Coding Linc in Colorectal Cancer[J]. International Journal of Molecular Sciences, 2017, 18(9):2003.
[4] Jemal A, Bray F, Center MM, et al. Global cancer statistics.[J]. Ca A Cancer Journal for Clinicians, 2015, 61(2):69-90.
[5] Stefano, Colagrande, Andrea, et al. challenges of advanced hepatocellular carcinoma[J]. 世界胃腸病学杂志:英文版, 2016, 22(34):7645-7659.
[6] Batista P, Chang H. Long Noncoding RNAs: Cellular Address Codes in Development and Disease[J]. Cell, 2013, 152(6):1298-1307.
[7] Redis R S, Sieuwerts A M, Look M P, et al. CCAT2, a novel long non-coding RNA in breast cancer: expression study and clinical correlations[J]. Oncotarget, 2013, 4(10):1748-1762.
[8] Gutschner T, Hmmerle M, Eimann M, et al. The Noncoding RNA MALAT1 Is a Critical Regulator of the Metastasis Phenotype of Lung Cancer Cells[J]. Cancer Research, 2013, 73(3):1180-1189.
[9] Qian Liu, Jianguo Huang, Nanjiang Zhou, et al. LncRNA loc285194 is a p53-regulated tumor suppressor[J]. Nucleic Acids Research, 2013, 41(9):4976-4987.
[10] 张德慧, 严雨姮. 长链非编码RNA LINC01772在肝细胞肝癌中的表达及临床意义[J]. 健康必读, 2018(36).120.