APP下载

NaCl胁迫下zma-miR059的表达及其抗盐性分析

2018-09-07毋若楠王争艳杨成成武永军

江苏农业科学 2018年16期
关键词:根系幼苗测序

王 红, 毋若楠, 王争艳, 杨成成, 武永军

(西北农林科技大学生命科学学院,陕西杨陵 712100)

土壤盐渍化导致环境退化,严重影响着作物的生长及产量。土壤中盐离子浓度过高会造成植物根系吸水困难,使植物体内含水量下降,膨压降低,引起植物细胞脱水死亡,甚至影响植物自身的生存[1]。目前,我国大约有0.33亿hm2盐碱地,而大量农作物耐盐性差,在盐碱地中无法种植,因此,如何提高农作物的耐盐性,对扩大我国耕地面积具有现实意义。

miRNAs是植物体内普遍存在的一类小分子非编码RNA,其长度在24 nt左右[2]。miRNAs广泛参与植物的生长发育、形态建成、果实发育、对生物和非生物胁迫的响应等过程[3]。研究发现,拟南芥[4]、玉米[5]中都存在响应盐胁迫的miRNAs。目前研究miRNAs功能的方法有过表达和基因沉默等。向娟等发现,在拟南芥中过表达番茄的miR397能够增强拟南芥的抗旱性[6]。2014年Gu等构建了沉默miR165/166的STTM(short tandem target mimic,即短串联靶标模拟)载体,导致转基因棉花中靶标基因的表达量明显上升[7]。

当土壤环境中盐离子浓度较高时,会破坏植物细胞内的离子平衡,引起膜功能异常,代谢活动减弱,从而影响生长[8]。当植物受到非生物胁迫时,活性氧积累且高度活跃,刺激植物通过抗氧化酶级联反应来清除活性氧[9],使植物体内清除活性氧相关酶超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,简称SOD)、过氧化物酶(peroxidase,简称POD)、过氧化氢酶(catalase,简称CAT)等活性升高[10-11]。此外,在胁迫下,细胞膜会发生膜脂过氧化,产生丙二醛(malonaldehyde,简称MDA),因此,可以通过丙二醛了解膜系统受伤害的程度[12]。保护酶活性及MDA含量已被广泛用来衡量植物受胁迫的程度。

笔者所在实验室在之前利用高通量测序研究了NaCl处理下玉米miRNAs的表达,发现zma-miR059的表达量在NaCl胁迫下显著上升。因此本研究以先玉335为试验材料,试图明确zma-miR059与盐胁迫的关系,以期为从转录后调控角度改进植物的耐盐性提供理论依据。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 玉米品种和接种的菌株 玉米品种为先玉335,载体pOT2-Poly-cis、pFGC5941-PacI和农杆菌GV3101为笔者所在实验室保存。

1.2 试验方法

1.2.1 材料处理和样品采集 将玉米种子进行消毒、萌发处理,当玉米芽长到2 cm时,用棉花包裹种子,留出根部,插入自制的玉米水培盆小孔中,每天用通气泵通气3次。用蒸馏水培养3 d后换Hoagland培养液培养至三叶期,挑出长势一致的玉米幼苗进行处理。分根处理(将玉米根系分为大致相等的2个部分):将2个部分的根分别放入正常的Hoagland培养液和含有200 mmol/L NaCl的Hoagland培养液中。全部根系NaCl处理:将玉米根系全部放入含有200 mmol/L NaCl的Hoagland培养液中。对照:将全部根系放入不含NaCl的Hoagland培养液中,培养2 d后,取样进行试验,每个处理设置3个重复。

培养条件:光—暗周期为15 h—9 h,昼—夜温度周期为28 ℃—20 ℃。

1.2.2 RNA提取和反转录 用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法提取叶片和根系总RNA。提取RNA后用GoScriptTMReverse Transcription System(Promega,上海)进行反转录,严格按照试剂盒说明书进行操作。反转录参照Chen等发明的stem-loop RT-PCR,设计反转录引物:5′-GTCGTA TCCAGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACTGGATACGACCGAC GATC-3′(5′末端是44个固定碱基,3′末端的8个碱基与miRNA成熟体的3′端互补配对)[13]。反应体系为20 μL:2.5 μL 总RNA、4 μL反应缓冲液、1 μL反转录引物、2 μL MgCl2、1 μL dNTPs、1 μL RNA酶抑制剂、1 μL 反转录酶,7.5 μL 水。反应条件:25 ℃ 5 min,42 ℃ 1 h,75 ℃ 15 min。

1.2.3 实时定量PCR 实时荧光定量PCR采用Promega公司的GoTaq®qPCR Master Mix,操作严格按照说明书进行。选择18S rRNA为内参,zma-miR059和内参的引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成(表1)。反应体系为 20 μL:10 μL 2×GoTaq®qPCR Master Mix,7.4 μL水,各 0.3 μL 上、下游引物(10 μmol/L),2 μL cDNA。反应条件:95 ℃ 5 min,95 ℃ 30 s,56 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,40个循环。在65~95 ℃,每升高0.5 ℃采集1次荧光,生成溶解曲线。每个样品设置3个重复,阴性对照以ddH2O为模板。表达量采用相对定量2-ΔΔCT法计算。

表1 实时定量PCR引物

1.2.4 SOD、CAT、POD活性及MDA含量的测定 参照高俊凤的方法进行CAT、SOD、POD活性和MDA含量的测定,均为鲜质量活性或含量[14]。

1.2.5 zma-miR059 STTM表达载体的构建 zma-miR059的序列为5′-ATCATGGCAGTGAGATCGTCG-3′,参照Yan等的方法[15]设计zma-miR059的STTM序列,整段序列如下:5′-CATTTGGAGAGGACAGCCCCGACGATCTCATAGCTG CCATGATGTTGTTGTTGTTATGGTCTAATTTAAATATGGTCTA AAGAAGAAGAATCGACGATCTCATAGCTGCCATGATGGTACG CTGAAATCACCAG-3′。根据上述序列设计引物,构建STTM-zma-miR059表达载体,引物序列详见表2。

表2 构建STTM-zma-miR059的引物

以pOT2-Poly-Cis质粒为模板,PCR扩增STTM(KOD-Plus-Neo,日本),对PCR产物进行回收纯化[天根生化科技(北京)有限公司],用Swa[New England Biolabs(NEB)公司,美国]酶切产物,4 ℃过夜自连,转化TOP10感受态细胞[天根生化科技(北京)有限公司],用卡那霉素(Kan)筛选,选择阳性菌落以STTM-F、STTM-R为引物送往生工生物工程(上海)股份有限公司测序,进行BLAST比对。

以连接成功的pOT2-STTM为模板,PCR删除复制起始位点,将产物回收纯化,用PacI[New England Biolabs(NEB)公司,美国]酶切pFGC5941-PacI和PCR片段,为了防止载体自连,用pFGC5941-PacI酶切120 min后再在体系中加入1 μL碱性磷酸酶(NEB,USA)处理30 min,纯化,4 ℃过夜连接,转化TOP10感受态细胞,筛选重组载体pFGC5941-STTM,选择阳性菌落,以STTM-F、STTM-R为引物送至生工生物工程(上海)股份有限公司测序,进行BLAST比对。测序验证正确后用液氮速冻法将重组质粒转化到农杆菌GV3101中。

2 结果与分析

2.1 NaCl处理对zma-miR059表达的影响

由图1可以看出,NaCl胁迫下玉米叶片、根系中的zma-miR059表达量均明显上升。全根NaCl处理下,叶片表达量是对照叶的3.71倍,根系表达量是对照根系的3.75倍。zma-miR059在分根NaCl处理下的叶片和盐处理侧根系中的表达水平也上升,但没有全根NaCl胁迫下的上升明显。分根NaCl处理组叶片的表达量比对照叶片上调了120%,盐处理侧根系的表达量比对照根系上调了85%,水处理侧根系的表达量与对照根系相当。结果显示,在NaCl胁迫下zma-miR059的表达量明显上升,与前期高通量测序结果一致,进一步表明zma-miR059是一个新的与NaCl胁迫相关的miRNA。

2.2 NaCl处理对玉米SOD、POD、CAT活性和MDA含量的影响

如图2-A所示,用NaCl处理后,玉米幼苗的叶片和根系中SOD活性均有所提高。NaCl处理对叶片中SOD活性的影响比对根系中SOD活性的影响更大;SOD活性在对照、分根NaCl处理和全根NaCl处理叶片中呈现出明显的上升趋势,且在全根NaCl处理的玉米叶片中SOD活性达到最大值;处理组根系中的SOD活性虽然也增加了,但没有叶片增加得明显。

NaCl处理能够在一定水平上影响幼苗的POD活性。如图2-B所示,NaCl处理后,叶片中的POD活性变化并不明显,其中分根NaCl处理呈现出微小的下降趋势。但是全根、分根NaCl处理的幼苗根系中POD活性均增加。

如图2-C所示,与POD、SOD的活性变化不同,NaCl处理后玉米幼苗根系和叶片中的CAT活性明显降低,特别是在全根NaCl处理的玉米幼苗中,CAT活性在其叶片中有明显降低,这与郑世英等的研究结果一致[16]。

如图2-D所示,NaCl处理对玉米幼苗的叶片和根系中MDA含量影响明显,全根NaCl处理的叶片中MDA含量是对照叶片中的4.25倍,分根NaCl处理的叶片中MDA含量是对照的2.06倍。全根NaCl处理的根系中MDA含量增加了 2.91 倍,分根处理的根系中MDA含量增加了2.01倍。经NaCl处理后,MDA含量在玉米幼苗叶片和根系的对照组、分根NaCl处理组及全根NaCl处理组中均呈现出明显的上升趋势。

2.3 zma-miR059-STTM表达载体的构建

按照第“1.2.5”节中描述的方法进行载体构建,对重组质粒进行菌落PCR或酶切鉴定,鉴定正确后通过测序最终确定STTM的序列。由图3可以看出,1、2、3泳道检测到的菌落PCR片段大小为134 bp,与预期大小一致,表明连接成功。由图4可以看出,酶切片段为删除pOT2-STTM复制起始位点的PCR片段,大小为2 837 bp,与PCR片段一样,说明 pFGC5941-STTM重组质粒连接成功。测序比对后显示序列正确,表明zma-miR059-STTM的表达载体构建成功。

3 讨论与结论

miRNA以调控靶标的方式在转录后水平参与植物对逆境胁迫的响应[17]。Ding等研究发现,用盐处理玉米根系时,miR166、miR319、miR395、miR399等表达水平显著改变[5]。本试验结果显示,用NaCl处理玉米幼苗时,叶片、根系的 zma-miR059表达量均升高,表明zma-miR059可能是玉米抗盐性相关的miRNA。此外,分根处理的玉米幼苗叶片和根系中zma-miR059的表达量低于全根NaCl处理,表明分根处理能够在一定程度上缓解玉米的胁迫情况,从而影响 zma-miR059的表达量。

植物体内的SOD、CAT和POD等抗氧化酶是检测活性氧代谢的生物标志物[18-20],MDA在植物受到伤害后产生,植物受外界胁迫越强,MDA含量越高[12,21-22],因此MDA含量及保护酶活性可以用来评判植物对外界胁迫的抵抗能力。全根NaCl处理和分根NaCl处理后,玉米幼苗叶片、根系中的SOD、POD活性均增加,表明NaCl胁迫导致植物体内膜脂过氧化、活性氧积累,而SOD等保护酶活性的增强可以有效清除活性氧,提高对胁迫的抵御能力。分根NaCl处理的玉米幼苗酶活性增加程度明显低于全根NaCl处理,表明在NaCl浓度相同时,分根NaCl处理的膜脂过氧化程度低于全根NaCl胁迫,分根处理会在一定程度上缓解植物的膜脂过氧化水平。NaCl处理后,玉米幼苗的叶片、根系中MDA含量明显增加,分根NaCl处理的玉米幼苗中MDA含量均低于全根NaCl处理,因此可见全根NaCl处理比分根NaCl处理会更大程度地损害植物膜系统。zma-miR059在根中的表达量变化趋势与MDA含量、POD活性变化趋势基本相同,都是胁迫后上升,且全根NaCl处理比分根处理增加幅度更大,进一步说明 zma-miR059 与玉米抵抗盐胁迫相关。

Yan等构建miR165/166的STTM载体侵染拟南芥后,出现了植株叶片不规则、矮小、弯曲的表型[15],与FranCo-Zorrilla等构建的TM载体[23]相比,Yan等构建的突变体沉默效率更高[15]。本试验表明,zma-miR059是1个与玉米盐胁迫相关的miRNA,为了进一步研究zma-miR059的作用机制,揭示其功能,笔者构建了STTM载体,并进行了农杆菌转化,下一步将获得STTM-zma-miR059转基因玉米,期望通过转基因玉米试验进一步明确zma-miR059与抗盐性的关系。

猜你喜欢

根系幼苗测序
种玉米要用“锌” 幼苗不得花白病
雅安市:织密根治欠薪“根系网”
二代测序协助诊断AIDS合并马尔尼菲篮状菌脑膜炎1例
根系分泌物解铝毒作用研究进展
烤烟漂浮育苗根系致腐细菌的分离与鉴定
长期膜下滴灌棉田根系层盐分累积效应模拟
默默真爱暖幼苗
基因捕获测序诊断血癌
单细胞测序技术研究进展
“五老”倾注心血 呵护“幼苗”成长