建昌黑山羊类固醇21-羟化酶基因部分序列的多态性研究
2018-08-17王慧宇赵龙范中涛吕珽
王慧宇,赵龙,范中涛,吕珽
(西昌学院,四川 西昌 615013)
建昌黑山羊广泛分布于凉山彝族自治州,该品种山羊耐粗饲、易管理、抗病力强、生产性能较高,在当地地方经济发展中占有很重要的地位[1]。DNA分子标记是以个体间核苷酸序列变异为基础的遗传标记,是DNA水平遗传变异的直接反映。在分子遗传标记中,单链构象多态性(SSCP)技术是最常用的方法之一,主要用于检测碱基突变[2]。类固醇21-羟化酶,是肾上腺类固醇激素合成调控的关键酶之一,由CYP21基因编码,包含10个外显子和9个内含子。17-羟孕酮及孕酮在21-羟化酶的作用下,分别转化成脱氧皮质醇和脱氧皮质酮,最终产物分别是去氧皮质醇和去氧皮质酮[3]。而17-羟孕酮、孕酮、皮质醇等类固醇激素在调节动物的繁殖、生长及生命活动中具有重要作用。
1 材料与方法
1.1 羊群来源及样本采集 检测羊群来自四川省会理县建昌黑山羊种羊场,采集具有不同产羔数的母羊的血液样本62份,记录其生产数据。每只羊都从颈部静脉采血5mL到真空采血管中,于实验室-20℃冰柜中保存备用。
1.2 主要试剂 血液基因DNA提取试剂盒、2×Taq PCR MasterMix(含染料)、Marker D2000、6×DNA Loading Buffer等生物制剂均购买自天根生化科技有限公司,30%Acr-Bis(29∶1)购买自 Biosharp 公司,其余是一些实验室常规药品。
1.3 DNA提取 血液样品室温下解冻,使用血液基因DNA提取试剂盒提取DNA。
1.4 引物设计与PCR扩增 根据CYP21基因DNA序列(GenBank登录号:NC_007324),对 CYP21基因第八外显子设计1对引物,目的片段大小为184bp,由杰李生物公司负责合成。
引物 1:CAGATTCAGCGCCGCCTTC;引物 2:ACT GCTAGGCCGCGTGGT。
PCR反应体系:DNA模版3.0μL,引物1、引物2(10μM)各 1μL,2×预混液 13μL,双蒸水补至 25μL,按照反应体系加入反应物混匀,按照PCR反应循环进行PCR扩增。
PCR反应循环设置:94℃预变性5min,94℃变性30s,57℃退火30s,72℃延伸15s,共35个循环;然后72℃延伸7min,4℃保存。
1.5 SSCP分析 取4μL PCR 产物和6μL 6×DNA Loading Buffer试剂混匀,98℃变性10min,然后冰浴5min。变性后的PCR产物在12%非变性聚丙烯酰胺凝胶中常温电泳12h,电泳结束后,银染显带,用凝胶成像仪分析。
12%非变性聚丙烯酰胺配方:30%非变性聚丙烯酰胺 12 mL,5×TBE 6 mL,10%过硫酸铵 200 μL,TEMD 15μL,加 ddH2O 12mL。
1.6 多态性分析 根据电泳结果进行基因多态性分析。
2 结果
2.1 PCR扩增 使用1%浓度的琼脂糖凝胶对PCR产物进行电泳,结果显示PCR产物特异性好,且符合目的条带大小(186bp),条带单一、明亮(见图 1)。2.2 SSCP分析 对PCR产物进行12%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,所有样品的电泳图像均显示为三根条带,无变化,不存在多态性样本(如图2所示)。
图1 PCR扩增产物图
图2 PCR产物的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳图
3 讨论
本次试验结果表明,建昌黑山羊CYP21基因的第八外显子基因序列不存在多态性,与其产羔数并无关联。闫艳[4]研究表明:辽宁绒山羊、波尔山羊、内蒙古绒山羊、济宁青山羊、安哥拉山羊5个山羊品种的CYP21基因第八外显子均没有多态性,与本试验结果一致,说明这段基因序列在各个山羊品种中的保守性高。杨志敏等[5]的研究结果表明:小尾寒羊、特克塞尔羊、多赛特羊、湖羊4个绵羊品种的CYP21基因第八外显子具有多态性。其原因可能是绵羊与山羊的CYP21基因本身就存在差别,绵羊CYP21基因第八外显子的保守性低,易突变,而建昌黑山羊的CYP21基因第八外显子具有高度保守性,出现基因突变的概率比较低所致;还可能是由于本次试验样本数量少,品种单一,未做不同品种间的比较所致。本试验初步得出建昌黑山羊的CYP21基因第八外显子不存在多态性,为以后建昌黑山羊的育种工作提供了借鉴。但建昌黑山羊CYP21基因的其余外显子是否存在多态性以及多态性是否与产羔数相关,还需进一步研究。