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基于植物rbcL基因测序对茶叶进行掺杂检验

2018-03-23王旻璇张永杰

生物工程学报 2018年2期
关键词:克隆产物测序

王旻璇,张永杰

山西大学 生命科学学院,山西 太原 030006

茶叶是我国具有传统优势的特色农产品,由茶树Camellia sinensis叶片经多种工艺加工而成,分成绿、黄、白、青、黑、红六大基本茶类[1]。现代研究发现,茶叶中含有黄酮类、酚酸类、非蛋白氨基酸、生物碱、聚胺类等多种生物活性物质,对控制体重、Ⅱ型糖尿病、心血管疾病等多种病症表现出有益的作用[2]。作为中华民族的传统饮品,茶叶的质量和安全直接影响人体健康,事关整个产业的发展和国家声誉。随着茶叶需求量的不断增大,茶叶消费市场以次充好、假冒伪劣甚至掺杂掺假现象时有发生[3-4],给正常的茶叶消费和进出口贸易造成不良的影响。茶叶掺假掺杂的常见方式有:用已陈化或发霉变质的茶叶冒充好的茶叶;用形态气味与茶叶相近的其他树叶冒充茶叶;用假茶、次茶掺入真茶当中;甚至重新晒干已经饮用过的茶叶来进行多次销售等[5]。此外,还有报道在茶叶中掺入淀粉、沙土、木灰、煤屑等[6]。在欧盟发布的有关“食品安全与食品掺假”的调查报告中,茶叶被列为欧盟市场易被掺假食品名单之一[7]。

传统的茶叶掺杂掺假鉴别检验的方式主要是感官检验和理化检验[5,8]。这些传统鉴别方式主要凭借业内人士的经验积累,普通消费者难以做到,并且难以准确鉴定出掺杂的植物种类。随着科学技术的发展,分子生物学鉴定技术逐渐渗透到各个生物领域,特别是聚合酶链式反应 (Polymerase chain reaction,PCR) 技术具有快速、灵敏、特异性高的特点,已广泛应用于植物性食品和药材中植物成分的检测[9-12],但在茶叶真伪鉴别领域的应用还较少。

通过PCR技术扩增一至数个DNA片段,可以进行物种识别,并可避免在传统鉴别方法中人为因素所造成的主观错判,从而有效地提高鉴别的准确性和效率。要对物种进行准确的鉴定,必须选择合适的DNA片段。2009年,生命条形码联盟植物工作组推荐将编码叶绿体核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶大亚基 (Ribulose 1,5-bisphosphate carboxylase-oxygenase large subunit,rbcL) 和成熟酶 K (Maturase K,matK) 的基因作为陆生植物的DNA条形码序列[15]。本研究报道一种基于植物叶绿体rbcL基因片段进行茶叶掺杂检测的方法,该方法能够定性判断茶叶中是否掺杂及所掺杂的具体植物成分,使茶叶的掺杂检测更加科学可靠。

1 材料与方法

1.1 研究材料

本研究共选用了7份茶叶样品 (表1),涉及六大茶类。

表1 本研究使用的茶叶样品信息Table 1 Tea samples used in this study

1.2 茶叶总DNA的提取和rbcL基因片段的扩增

分别称取每种茶叶样品 0.13 g于 1.5 mL Eppendorf管中,用手持式G50研磨器 (卡尤迪生物科技有限公司) 研磨茶叶,并用CTAB (十六烷基三甲基溴化铵) 法提取总DNA[16]。从提取的茶叶总DNA中使用KOD-Plus DNA聚合酶 (东洋纺(上海) 生物科技有限公司) 在 T100 PCR 仪(美国BIO-RAD公司) 上扩增rbcL基因片段,共需进行两轮 PCR。第一轮 PCR使用引物组合 rbcLa_F[17]和724R[18],扩增产物约750 bp;第二轮PCR使用引物组合rbcLa_F和rbcLa_R[19],扩增产物约600 bp。引物序列信息见表 2。第一轮扩增以提取的茶叶总DNA为模板;第二轮扩增以第一轮扩增产物稀释50倍的稀释液为模板。两轮PCR各进行40个循环,退火温度分别为54 ℃和52 ℃。将第二轮扩增所得的扩增产物全部用于琼脂糖凝胶电泳,使用 Gel Extraction kit (OMEGA公司) 进行切胶回收。

表2 本研究使用的引物信息Table 2 Primers used in this study

1.3 rbcL基因片段的克隆与测序

取 4 μL切胶纯化的 DNA 片段与 1 μL pEASY-Blunt3克隆载体 (全式金生物技术有限公司) 混合后16 ℃过夜连接。连接产物用于转化大肠杆菌DH5α菌株,随机挑选约10个阳性克隆用载体引物M13F或PCR引物rbcLa_F测序。同时,将切胶纯化的PCR产物用rbcLa-F进行直接测序。

1.4 测序结果的分析

通过 FinchTV软件 (http://downloads.informer.com /finchtv/) 观察PCR产物直接测序所得的测序峰图中是否有杂峰,据此可粗略判断样品的纯度。精确判断时,首先除去克隆测序所得序列中的载体序列,然后对留下的rbcL序列在GenBank (https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi) 和/或 BOLD (http://www.barcodinglife.org/index.php/IDS_OpenIdEngine) 数据库中进行Blast (基于局部比对算法的搜索分析)搜索,确定rbcL序列所代表的植物种类。利用MEGA 6.06软件[20]对克隆获得的rbcL序列进行多重比对,切齐两端序列后用邻接法构建系统发育树,自展值1 000次重复。

2 结果与分析

2.1 rbcL基因片段扩增结果

通过两轮PCR扩增,从7份茶叶样品中都得到了明亮的rbcL扩增条带 (图1),可用于本研究的测序和克隆分析。

图1 7份茶叶样品rbcL扩增结果的电泳图Fig.1 Electrophoretic patterns of rbcL amplicons from seven tea samples.Please refer to Table 1 for codes of these tea samples.Mr indicates Trans2K Plus DNA Ladder.

2.2 信阳毛尖的检验结果

信阳毛尖 (M) 扩增产物直接测序的峰图中无套峰,即测序图谱上每个位点只识别出一种碱基(图2)。将该扩增产物转化大肠杆菌后挑选10个阳性克隆 (M1-M10) 进行测序,所得序列经 Blast分析全部为茶树C.sinensis的序列。

图2 rbcL扩增产物直接测序显示无套峰的图谱示例Fig.2 A representative chromatogram of direct sequencing of rbcL amplicons without heterozygous peaks.

2.3 岳阳黄茶的检验结果

岳阳黄茶 (H) 扩增产物直接测序的峰图同信阳毛尖一样,没有显示套峰位点。挑选8个阳性克隆 (H1–H5,H7–H9) 进行测序,所得序列全部为茶树C.sinensis。

2.4 太姥银针的检验结果

太姥银针 (L) 扩增产物直接测序的峰图显示部分位置有套峰 (图3)。对10个阳性克隆进行测序的结果显示,3个克隆 (L4、L7和L10) 为茶树C.sinensis的序列,2个克隆 (L1和L3) 为茶属(Camelliaspp.) 植物的序列 (其与茶树C.sinensis的序列相似性最高约98%,无法确切判断是否为茶树),1个克隆 (L8) 为芭蕉属 (Musaspp.) 植物的序列,1个克隆 (L2) 为伞形花科(Apiaceae) 植物的序列,1个克隆 (L9) 为荚蒾属(Viburnumspp.) 植物的序列 (与公共数据库中的rbcL序列相似性最高约 96%),1个克隆 (L5) 可能为金虎尾科(Malpighiaceae) 植物的序列 (与公共数据库中的rbcL序列相似性最高约95.5%),1个克隆 (L6) 为被子植物门 (Magnoliophyta) 植物的序列 (与公共数据库中的rbcL序列相似性最高只有94%)。

图3 rbcL扩增产物直接测序显示有套峰的图谱示例Fig.3 A representative chromatogram of direct sequencing of rbcL amplicons with heterozygous peaks.

2.5 铁观音的检验结果

铁观音 (T) 扩增产物直接测序的峰图显示部分位置有套峰 (类似图3)。对10个阳性克隆进行测序的结果显示,7个克隆 (T2–T6、T8和T9)为茶树C.sinensis的序列,1个克隆 (T7) 为芭蕉属(Musaspp.) 植物的序列,1个克隆 (T10) 为葫芦科的黄瓜Cucumis sativus,1个克隆 (T1)为双子叶植物纲 (Magnoliopsida) 某植物的序列 (与公共数据库中rbcL序列的相似性最高只有97%,无法确认到更低级的分类单元)。

2.6 正山小种的检验结果

正山小种 (Z) 扩增产物直接测序的峰图显示部分位置有杂峰 (类似图3)。对9个阳性克隆进行测序的结果显示,3个克隆 (Z5、Z7和 Z8)为茶树C.sinensis的序列,2个克隆 (Z1和Z3)为杨柳科柳属 (Salixspp.) 植物的序列,2个克隆(Z4和Z10) 为伞形花科 (Apiaceae) 植物的序列,1个克隆 (Z2) 为葫芦科的黄瓜 (C.sativus),1个克隆 (Z6) 为芸香科 (Rutaceae) 植物的序列。

2.7 六堡茶的检验结果

六堡茶 (B) 扩增产物直接测序的峰图显示部分位置有套峰 (类似图3)。对10个阳性克隆进行测序的结果显示,2个克隆 (B3和B4) 为茶树C.sinensis的序列,2个克隆 (B7和B9) 为伞形花科 (Apiaceae) 植物的序列,2个克隆 (B2和B8) 为豆科 (Fabaceae) 植物的序列,2个克隆(B1和 B5) 为葫芦科 (Cucurbitaceae) 植物的序列,2个克隆 (B6和 B10) 为双子叶植物纲(Magnoliopsida) 某植物的序列 (与公共数据库中的rbcL序列相似性最高只有96.5%)。

2.8 宫廷普洱的检验结果

宫廷普洱 (P) 扩增产物直接测序的峰图显示部分位置有套峰 (类似图3)。对10个阳性克隆进行测序的结果显示,3个克隆 (P6,P8和B10)为茶树C.sinensis的序列,2个克隆 (P1和P7) 为胡麻科芝麻Sesamum indicum的序列,2个克隆(P2和P3) 为唇形目 (Lamiales) 植物的序列,1个克隆 (P4) 为伞形花科 (Apiaceae) 植物的序列,1个克隆 (P5) 为蔷薇科 (Rosaceae) 植物的序列,1个克隆 (P9) 为芭蕉科芭蕉属 (Musaspp.)植物的序列。

2.9 不同茶叶样品掺杂植物成分的比较

图4 利用克隆检测到的rbcL序列构建的系统发育树Fig.4 Phylogenetic tree constructed using rbcL sequences generated from clone sequencing.Please note that when searching online reference databases, some rbcL sequences can only be identified to above-species level taxonomy.

利用克隆测序所得的全部rbcL序列构建系统发育树 (图 4)。从中可知,一些植物成分仅在特定的茶叶中检测到,如唇形目芝麻仅发现于普洱茶中,柳属植物仅发现于正山小种中;另一些植物成分可在不同的茶叶中同时检测到,如在正山小种和铁观音中都检测到黄瓜,在铁观音、普洱茶和太姥银针中都检测到某芭蕉属植物。

3 结论与讨论

对于茶叶中掺杂植物成分的检测,传统的方法是通过宏观和微观形态来识别其中的植物成分,然而有些茶叶经包装或粉碎后,很难辨认其中的植物成分。利用分子生物学方法进行检测,不受植物形态和加工过程的影响,可用于食物原材料的鉴定、溯源和掺伪检测等[9-14],但在茶叶掺杂掺假检测方面的应用还比较少。本研究建立了基于植物rbcL基因序列定性检测茶叶中是否掺杂其他植物成分的方法。使用该方法时,直接观察rbcL的测序峰图,就可基本确定某茶叶样品是否掺杂;对rbcL扩增产物进行克隆测序和序列分析,可进一步确定掺杂的具体植物种类。理论上讲,另一个植物DNA条形码片段matK也应可用于本研究,但我们前期发现从茶叶样品中扩增matK的成功率不如rbcL高[21],因此我们选用了rbcL进行研究。

利用所建立的方法对 7份茶叶样品进行检测,发现正山小种、铁观音、太姥银针、六堡茶、宫廷普洱都不同程度地混杂有其他植物成分。从这 5种茶叶中,共检测到近 20种污染植物成分(图4)。我们之前从部分普洱熟茶样品中检测到芭蕉属、松属Pinus和芸薹属Brassica的植物成分[21]。本研究检测到了芭蕉属的植物,但没有检测到松属和芸薹属的植物。普洱茶和六堡茶作为后发酵茶,在加工过程中有“渥堆发酵”的过程[22];渥堆发酵中用到的覆盖物和翻堆工具等都可能带进污染。其他茶叶中是如何掺杂进其他植物成分的,以及为什么要进行掺杂尚不清楚。尽管本研究从茶叶中检测到多种植物成分,但其中并没有已知的明显产毒性物质的植物成分。

本研究的主要目的是建立检测茶叶中是否掺杂其他植物成分的方法,因此每一茶类只选取了1–2份代表性的茶叶样品。各类茶叶中掺杂植物成分的整体状况如何,有待今后通过对大量样品的检测分析才能知晓。可以预见,通过分析大量的茶叶样品后,还会从茶叶中检测出更多的植物成分。例如,本研究并没有检测到文献中所报道的杨树、小麦、玉米、大豆等植物成分[3,23]。

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