Goldeneye 25A身份识别系统在回族人群的法医遗传学多态性

杨 俊，胡如芳

（衡阳市公安局 刑侦支队，湖南 衡阳421001）

Goldeneye 25A身份识别系统（基点认知技术（北京）有限公司）是在Goldeneye 20A身份识别系统的基础上，新增加了4个在中国人群中多态性丰富的欧洲核心基因座（D1S1656，D2S441，D10S1248，D19S253）以及一个用于排除因 Amelogenin（Amel）等位基因丢失造成性别误判的Y-STR基因座DYS391[1]。该试剂盒可以一次完成23个常染色体STR基因座、一个性别基因座以及一个Y-STR基因座，兼容了欧洲及美国的数据库建设要求，在五色荧光检测的基础上尽量多的获取遗传信息。鉴于该试剂盒尚无在回族人群中进行群体数据调查，本研究采用这一身份识别系统对200名回族个体的遗传多态性进行调查，以期为法医学应用及研究提供基础数据。

表1 Goldeneye 25A身份识别系统中STR基因座在回族人群中的等位基因及频率分布（n=200）

1 材料与方法

1.1 样本

本研究共采集200名回族健康自愿者的血样，其中男性100名，女性100名。对每名志愿者均进行风险告知，并签署知情同意书。

1.2 试剂与仪器

Goldeneye 25A身份识别系统（基点认知技术（北京）有限公司）、9700型扩增仪和3130 XL型遗传分析仪（美国Thermo Fisher Scientific公司）。

1.3 PCR扩增和STR分型

采用Chelex-100法进行血样DNA的提取[2]。按照说明书标准体系对其中包含的23个常染色体STR基因座、DYS391基因座和 Amelogenin进行PCR扩增。PCR产物变性后在3130 XL型遗传分析仪上进行毛细管电泳，用GeneMapper ID v3.2.1软件对STR基因座进行分型。

1.4 统计学分析方法

采用PowerMarker v3.25软件[3]对试剂盒中涉及的23个常染色体STR基因座进行Hardy-Weinberg（H-W）平衡检验和等位基因分布频率的计算；根据等位基因频率，进行法医学参数（个体识别能力、杂合度、非父排除率和多态信息含量）计算。对其中的DYS391基因座采用直接计数法进行等位基因频率的调查，基因变异度和父权排除概率的计算参见文献[4]。

2 结果与讨论

本次检测中共涉及200份样本，其中100份男性样本在DYS391基因座均检测到1个等位基因，Amel检测结果为X/Y，100份女性样本在DYS391基因座检测结果均为阴性，Amel检测结果为X/X。

经H-W平衡检验，23个基因座的检验p值均大于0.05，等位基因频率分布见表1，法医学相关参数见表2。其中，检测到最多等位基因的基因座为Penta E，本次共检测到19个，个体识别能力达0.9848，非父排除率为0.8162，多态信息含量为0.9060。但是在CODIS基因座D3S1358上仅检测到5种等位基因，且等位基因15和16在人群中的频率总和达0.66。检测结果发现TPOX和TH01基因座在回族人群中的多态性最差，多态信息含量分别为 0.6338和0.6411，这一检测结果与Sinofiler检测试剂盒中尝试采用多态性更为丰富的D12S391和D6S1043基因座替代TPOX和TH01的初衷一致[5]。经连锁不平衡检验，Goldeneye 25A身份识别系统中含有的23个常染色体STR基因座之间相互独立，采用乘积定律计算，累积个体识别概率为1-6.88×10-29，累积非父排除概率为1-7.67×10-11，可以应用于法医学个体识别及亲权鉴定案件中。对其中含有的Y-STR基因座共检测到6种等位基因，在回族人群中的基因变异度为0.4547，父权排除概率为0.4524，在样本的性别判断及父系关系上可以辅助提供一定的遗传信息。以上数据均表明该身份鉴定系统在回族人群中遗传信息丰富，可以为法医学实际检案及建库应用。

表2 Goldeneye 25A身份识别系统中23个常染色体STR基因座在回族人群中的法医学参数 （n=200）

[1]Suhua Zhang， Yingnan Bian， Huaizhou Tian， et al.Development and Validation of a new STR 25-plex Typing System[J].Forensic Science International:Genetics，2015，（17）：61-69.

[2]Walsh PS，Petzger DA，Higuchi R.Chelex-100 as Medium for Simple Extraction of DNA for PCR-based Typing from Forensic Material[J].Biotechniques， 1991，（10）:506-513.

[3]Liu K， Muse SV.（2005） PowerMarker:an Integrated Analysis Environment for Genetic Marker Analysis[J].Bioinformatics， 2005，（21）：2128-2129.

[4]Buckleton JS，Triggs CM，Walsh SJ.Forensic DNA Evidence Interpretation[M].CRC Press， Boca Raton， FL， 2005.

[5]张茂修，韩淑毅，高洪梅，等.山东汉族人群19个STR基因座的遗传多态性[J].法医学杂志，2013，29 （6）:440-446.