温度对基因组DNA提取的影响
2017-06-09常瑞刚刘丽霞
常瑞刚,刘丽霞
(西北民族大学生命科学与工程学院,兰州 730030)
温度对基因组DNA提取的影响
常瑞刚,刘丽霞
(西北民族大学生命科学与工程学院,兰州 730030)
为了探讨温度对基因组DNA提取质量的影响,以荷斯坦牛血液为实验材料,采用DNA提取试剂盒法在4℃和常温下提取牛血液DNA。结果表明:在4℃下提取的DNA质量要明显高于常温下所提取的。该研究对于提高DNA提取质量具有一定的参考价值。
温度;质量;DNA提取
随着分子生物学技术的快速发展,在动物遗传育种 研究以及基因工程等分子水平的操作均需从生物体中提取基因组DNA。提取基因组DNA的方法种类繁多,目前主要分成两种,一是经典的酚-氯仿抽提法,二是试剂盒法。酚-氯仿抽提法价格便宜,但操作繁琐,而且获得基因组DNA质量欠佳;试剂盒法的优点是简便、快捷,且DNA提取效率较高[1]。目前试剂盒法应用十分广泛,在提取基因组DNA的过程中,DNA的质量受多种因素的影响,提取的DNA质量会影响后续实验结果的可靠性,其中温度是影响其质量的一个重要因素。因此,本实验采用DNA提取试剂盒法在4℃和常温下提取牛血液DNA,旨在探讨温度对DNA提取质量的影响。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 实验样本 本实验以宁夏贺兰山奶业有限公司同一奶牛场荷斯坦牛为实验动物。用医用采血管经尾静脉采血10 mL,-20℃冻存备用。
1.1.2 实验设备 自动平衡离心机Labofuge 200和高速冷冻离心机D-37520(德国Eppendorf公司),低温冰箱MDF-U541(日本SANYO电子有限公司),凝胶数字成像系统BiO-BEST 140E(美国西蒙子公司)等。
1.2 方法
采用DNA试剂盒法分别在4℃和常温条件下提取牛血液DNA,操作步骤如下。
(1)取牛血液20 μL,不足200 μL可加缓冲液GA补足。
(2)加入20 μL蛋白酶K溶液,混匀。
(3)加入200 μL缓冲液GB,充分颠倒混匀,70℃放置10 min,溶液应变清亮,简短离心以去除管盖内壁的水珠。
(4)加入200 μL无水乙醇,充分振荡混匀15 s,此时可能会出现絮状沉淀,简短离心以去除管盖内壁的水珠。
(5)将上一步所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱CB3中(吸附柱放入收集管中),12 000 r/min离心30 s,倒掉废液,将吸附柱CB3放回收集管中。
(6)向吸附柱CB3中加入500 μL缓冲液GD,12 000 r/min离心30 s,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中。
(7)向吸附柱CB3中加入700 μL漂洗液PW,12 000 r/min离心30 s,倒掉废液,将吸附柱CB3放入收集管中。
(8)向吸附柱CB3中加入500 μL漂洗液PW,12 000 r/min离心30 s,倒掉废液。
(9)将吸附柱CB3放回收集管中,12 000 r/min离心2 min,倒掉废液。将吸附柱CB3置于室温放置数分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
(10)将吸附柱CB3转入一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加25 μL ddH2O(预热),室温放置2~5 min,12 000 r/min离心2 min,将溶液收集到离心管中。
2 结果与分析
本实验研究结果显示,采用0.8%琼脂糖凝胶电泳分析所提取的DNA含量均较高。但相比之下4℃所提取的DNA含量更高,浓度更大,除样品条带外未出现其他条带,表明所提取的DNA未受外源核酸和蛋白质的污染,无断裂,且分子大小相同。6个试验样品迁移率几乎相同。见图1。
图1 不同温度条件下提取的DNA琼脂糖凝胶电泳图
3 讨论
从动物血液中获得高质量的DNA是进行分子遗传育种研究所必需的。在血液中,DNA与蛋白质结合形成染色体,存在于细胞核中,因此,在提取DNA时既要将蛋白质等物质除尽,又要尽可能保持DNA分子的完整性,即DNA带不断裂,且无外源核酸污染。
本实验结果表明,4℃下所提取的DNA浓度更大,含量更高;而常温下所提取的DNA浓度虽然也较高,但条带不整齐且点样孔有亮度,表明有外源核酸和蛋白质的污染。本实验采用DNA提取试剂盒法,在常温条件下提取DNA,由于离心机高速旋转产生大量热量,导致部分基因组DNA降解;而在4℃条件下提取DNA,温度低,血液细胞释放的内源核酸酶活性较低,因此能够保证DNA的完整性。
综上所述,在4℃条件下提取可获得较高质量的基因组DNA。
[1] 覃莉,江莉,李慕军,等.人类精液DNA提取方法的探讨及影响因素分析[J].广西医学,2013(4):406-410.
S823.2
A
2095-3887(2017)03-0073-02
10.3969/j.issn.2095-3887.2017.03.021
2017-03-28
西北民族大学中央高校基本科研业务费专项资金项目(31920170029);西北民族大学本科生科研创新项目
常瑞刚(1995-),男,在读本科生。
刘丽霞(1983-),女,高级实验师,博士,主要从事动物遗传育种与繁殖研究工作。