AIDA—1基因的克隆与鉴定
2016-10-21袁锦雯高珮芬马珺茹王怡琳续苪赵李祥
袁锦雯 高珮芬 马珺茹 王怡琳 续苪 赵李祥
摘要:为了克隆AIDA-1基因并对其定序,通过PCR方法从大肠杆菌E393中扩增出AIDA-1基因,通过酶切的方法克隆到pMD19-T simple载体中,再转化入感受态大肠杆菌,并通过基因测序的方法测定了AIDA-1的序列。 结果表明:成功克隆并测定了AIDA-1的序列,为蛋白展示、疫苗开发提供了重要的材料。
关键词:克隆; 测序; AIDA-1基因
中图分类号:Q36
文献标识码:A 文章编号:16749944(2016)08018401
1 引言
AIDA-1为革兰氏阳性菌的IV型分泌系统,可在革兰氏阴性菌表面形成桶装结构,展示其N-端携带的蛋白[1~3]。IV型分泌系统在革兰氏阴性菌表面展示外源蛋白的过程中,无需其他因子的辅助,因此是方便高效的细菌表面展示系统。该展示系统在疫苗的研制及表位筛选等方面具有很大的优势。本研究拟通过PCR方法,获取AIDA-1基因。
2 材料与方法
2.1 引物设计
根据NCBI上公布的AIDA-1的序列设计了上、下游引物。
2.2 PCR扩增
取1 mL对数生长期的大肠杆菌E393,煮沸10 min,12000 rpm离心2 min,取上清作为PCR模板[4~6]。PCR反应体系为50 μL其中包含:5 μL大肠杆菌模板,5 μL PCR反应缓冲液,1 μL dNTP,上、下游引物各1 μL,Taq酶1 μL,灭菌超纯水36 μL。将PCR反应混合液混匀后,通过如下程序进行PCR扩增:94 ℃ 4 min,94 ℃ 1 min、 57 ℃ 1 min、72 ℃ 2 min 共30个循环,72 ℃ 10 min, 4 ℃ 10 min。取20 μL的PCR产物,在1%的琼脂糖凝胶中进行电泳,条件为80 V 50 min。
2.3 PCR产物的回收及连接
按照凝胶回收试剂盒说明回收AIDA-1产物。分别取4 μL PCR产物、1 μL pMD19-T simple载体及5 μL连接缓冲液,轻轻混匀后置于4 ℃连接过夜。
2.4 转化及序列测定
取10 μL连接产物,加入到100 μL新鲜的DH10B的感受态细菌中,轻轻混匀,冰浴30 min;在42 ℃水浴锅中热休克90s;立即加入800 μL的LB培养基,并轻轻混匀,置于37 ℃摇床中培养50 min。取400 μL培养物涂布于含有IPTG、V-gal及氨苄青霉素的LB平板中,37 ℃培养过夜。挑取平板上的白色菌落进行测序分析。
3 结果与结论
通过PCR成功扩增出目的片段,经DNA测序表明AIDA-1基因被成功克隆至T载体中。克隆的AIDA-1基因片段,可广泛应用于革兰氏阴性菌表面展示。该表面展示系统可以在细菌表面展示外源蛋白,可与流式细胞术等高通量的检测及分离方法结合,应用于疫苗的制备、生物吸附剂的研制及抗原表位的筛选等领域。因此,本研究克隆的AIDA-1基因為我们后期的研究提供了材料基础,具有广泛的应用前景和应用价值。
参考文献:
[1]Stordeur P, Marlier D, Blanco J, et al. Examination of Escherichia coli from poultry for selected adhesin genes important in disease caused by mammalian pathogenic E. coli[J]. Vet. Microbiol, 2002, 84(3):231~41.
[2]吴琛耘,吴建和,刘晶星.细菌的Ⅲ型和Ⅳ型分泌系统[J].国外医学(微生物学分册),2004,27(2):19~21.
[3]原志伟,朱国强.细菌I型分泌系统研究进展[J].生物技术通讯,2007,18(1):129~131.
[4]张少峰,刘国强,魏春雷,等。粪大肠杆菌检测方法及研究进展[J]. 海洋通报,2008,27(3):102~106.
[5]罗 樨,王 强,赫 然,等。大肠杆菌质粒DNA PCR模板的快速制备[J].生物技术,2002,11(2):38.
[6]苏应斌,莫道君,戴天力.改进的PCR模板制备及DNA回收方法[J].湖北医科大学学报,1997,18(1):24~25.