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柳州市16例吸毒者HIV-1病毒流行株亚型分布及耐药情况分析

2016-10-19陈柳军余钧池黄萍钟祥海刘鑫

中国卫生产业 2016年25期
关键词:柳州市毒株亚型

陈柳军,余钧池,黄萍,钟祥海,刘鑫

柳州市疾病预防控制中心,广西柳州545007



柳州市16例吸毒者HIV-1病毒流行株亚型分布及耐药情况分析

陈柳军,余钧池,黄萍,钟祥海,刘鑫

柳州市疾病预防控制中心,广西柳州545007

目的了解2011—2013年柳州市吸毒人群人类免疫缺陷病毒1(human immunodeficiency virus 1,HIV-1)亚型分布和毒株耐药情况。方法从2011—2013年柳州市吸毒人群HIV-1感染者中,随机抽取16例作为研究对象,从血浆中抽提核酸RNA,用RT-PCR进行gag及pol基因扩增,并对扩增产物进行测序和序列分析。结果16例标本中存在2种HIV-1亚型:重组亚型CRF01_AE 14例(87.5%),重组亚型CRF07_BC 2例(12.5%)。6株发生相关耐药突变,主要发生在NRTIs和NNRTIs相关突变。结论2011~2013年柳州市吸毒人群HIV-1感染主要以CRF01_AE为主,主要在NRTIs和NNRTIs相关耐药突变。

HIV-1;吸毒人群;基因亚型;耐药

获得性人类免疫缺陷综合症简称艾滋病,是由人类免疫缺陷病毒(human Immunodeficiency virus,HIV)引起的一种慢性传染病。HIV在我国的流行始于1985年,经过散发期、蔓延期后,于1995年进入了快速增长期,HIV感染在全国范围内急剧上升,如不采取有效的控制措施,今后将会有更多的HIV感染者。中国自1996年在静脉吸毒人群(IDU)中发现首例本土HIV感染者以来,感染人数逐年上升。而柳州市是艾滋病疫情严重的地区之一,感染方式主要以性传播、静脉吸毒为主。了解近几年柳州市吸毒者HIV-1病毒流行株亚型分布及耐药情况,对于防控柳州市艾滋病的传播、治疗有重大意义。

1 材料与方法

1.1标本来源

从2011—2013年柳州市吸毒人群HIV感染者中,随机抽取16例。所有研究对象均经免疫印迹实验(WB)确认为HIV-1阳性。

1.2主要试剂

病毒DNA/RNA提取试剂盒购自西安天隆公司、核酸扩增试剂盒PrimeScript one step RT-PCR、Premix TaqTM、LA TaqTM Version 2.0 plus dye和普通琼脂糖购自大连宝生物TaKaRa。

1.3核酸提取、扩增及测序

使用病毒DNA/RNA提取试剂盒从200 μL保存好的血浆中提取HIV RNA,采用巢式PCR方法扩增HIV-1 gag、pol基因片段,扩增引物如表1所示。巢式PCR第一步扩增使用PrimeScript one step RT-PCR试剂盒,第二步扩增采用Premix TaqTM LA TaqTM Version 2.0 plus dye试剂盒。第二步扩增产物经琼脂糖电泳验证后,送北京六合华大基因科技股份有限公司测序。

表1 扩增gag、pol基因片段的反应引物

1.4亚型分析

用Chromas查看测序所得序列,Vector NTI Suite 10的Contig Express进行序列拼接,ClustalX2进行序列比对,经BioEdit序列比对、修饰后,用MEGA 5软件的Neighbor-Joining法构建系统进化树,所得进化树用Bootstrap法检验(重复500次),根据序列与参考序列的聚集情况确定病毒亚型,参考序列均来自Los Alamos National Laboratory HIV database(http://www.hiv.lanl.gov/)。

1.5耐药性分析

将测序所得pol基因序列提交至美国斯坦福大学HIV耐药性数据库(Stanford University HIV Drug Resista nce Database,http://hivdb.stanford.edu/),点击进入HIV db PROGRA,输入已测序列即可获得各序列的耐药位点及相关耐药信息。

2 结果

2.1基因分型

16份样本成功扩增测序得到14条gag和11条pol基因片段,将基因序列输入到HIV BLAST中,发现CRF01_AE 14例,占87.5%(14/16),CRF07_BC 2例,占12.5%(2/16)。将gag基因片段序列与典型高频参考序列进行比对,应用MEGA 5软件构建系统进化树,见图1,图中实心圆圈“●”代表典型的高频出现的共享序列,黑色实心三角“▲”代表测序后的基因片段。从系统进化树可以看出,重组亚型CRF01_AE高频参考序列出现的城市主要来自广西、福建、江苏、辽宁、四川,重组亚型CRF07_BC对应的高频参考序列出现的城市主要有广西、北京、新疆。

2.2耐药分析

在获得的基因序列中,有6株产生耐药相关突变,见表1。蛋白酶抑制剂(PIs)相关突变有一种,为L10V;核苷类逆转录酶抑制剂(NRTIs)相关突变有7种,分别为T69N、V75C、A62V、F116Y、Q151M、M184V和K65R;非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)相关突变有五种,分别为Y181C、K101H、G190A、L100I和K103N。耐药性分析发现,PIs相关突变为潜在低度耐药,不会引起病毒对药物敏感性的改变;在NRTIs相关突变中,Q151M突变或M184V突变可引起毒株对拉米夫定(3TC)和恩去他滨(FTC)产生高度耐药,K65R突变可引起毒株对替诺福韦(TDF)、双脱氧肌苷(ddI)、阿巴卡韦(ABC)和司他夫定(d4T)产生中度或高度耐药;在NNRTIs相关突变中,K103N突变可引起毒株对奈韦拉平(NVP)产生高度耐药,G190A突变可引起毒株对NVP产生高度耐药及对依非韦仑(EFV)中度耐药。见表2。值得引起注意的是,在11例患者中,有2例患者出现了NRTIs,NNRTIs双突变。

表2 HIV-1流行株耐药相关突变位点及种类

图1 基于gag基因片段序列构建的进化树

3 讨论

该研究对柳州市16例吸毒者HIV-1病毒流行株进行基因亚型分析,发现柳州市吸毒人群HIV-1亚型主要以重组亚型CRF01_AE为主,其次为重组亚型CRF07_BC,没有发现重组亚型CRF08_BC,这与广西HIV分子流行病学调查结论一致[1]。其中,CRF01_AE与广西、福建、江苏、辽宁、四川流行株的相似性较高,CRF07_BC与广西,北京。新疆流行株的相似性较高。在上世纪90年代,中国首次在云南和广西确认CRF01_AE重组型毒株,随后在性传播和吸毒高危人群中传播[2-3],在2006年的全国HIV分子流行病学调查中发现,CRF01_AE重组型毒株已迅速成为我国最广泛流行的毒株[4-5],至今在各个感染途径中,仍占主要位置。由于柳州市吸毒人群HIV-1亚型没有发现CRF08_BC,而广西全省流行的HIV-1亚型存在有CRF01_AE、CRF07_BC、 CRF08_BC、CRF55_01B和B型,因此对柳州市吸毒人群的HIV防治工作,应制定符合本地方特色的策略,方能更好地控制HIV的蔓延。

从该次耐药研究中发现,吸毒人群HIV-1感染者经过抗病毒治疗后已有部分感染者产生耐药,PIs相关突变为潜在低度耐药,不会引起病毒对药物敏感性的改变;NRTIs相关突变存在着Q151M突变、M184V突变及K65R突变,该突变可引起HIV-1毒株对3TC、FTC、TDF、ddI、ABC和d4T产生中度或高度耐药;NNRTIs相关突变存在着K103N突变和G190A突变,该突变可引起毒株对NVP和EFV产生中度或高度耐药。随着柳州市抗病毒治疗人群的增加,治疗人群的耐药情况也会越发严重,并可能发生扩散,这对柳州市艾滋病防控、治疗提出了严峻考验。由于该次研究样本量较少,而对于HIV-1流行株耐药情况分析,需进行连续动态监测,方能及时发现新的耐药情况。因此,今后需加强该方面的监测工作,为柳州市HIV-1抗病毒治疗和防止耐药株传播提供技术支持。

[1]苏齐鉴,周平,闭志友,等.柳州和南宁市HIV-1亚型分布及耐药情况调查[J].病毒学报,2010,7(4):290-294.

[2]Liao H,Tee KK,Hase S,et al.Phylodynamic analysis of the dissemination of HIV-1 CRF01_AE in Vietnam[J].Virology,2009,391(1):51-56.

[3]Yu XF,Chen J,Shao Y,et al.Two subtypes of HIV-1 among injection-drug users in southern China[J].Lancet,1998,351(9111):1250.

[4]Zhao B,Han X,Dai D,et al.New trends of primary drug resistance among HIV type 1-infected men who have sex with men in Liaoning Province,China[J].AIDS Res Hum Retroviruses,2011,27(10):1047-1053.

[5]Zhang X,Li S,Li X,et al.Characterization of HIV-1 subtypes and viral antiretroviral drug resistance in men who have sex with men in Beijing,China[J].AIDS,2007,21(Suppl 8):S59-S65.

Analysis of HIV-1 Virus Epidemic Strain Subtype Distribution in 16 Cases of Drug Users in Liuzhou and Drug Resistance

CHEN Liu-jun,YU Jun-chi,HUANG Ping,ZHONG Xiang-hai,LIU Xin
Center for Disease Prevention and Control,Liuzhou,Guangxi Province,545007 China

Objective To know the HIV-1 virus epidemic strain subtype distribution in drug users in Liuzhou from 2011 to 2013 and drug resistance.Methods 16 cases of HIV-1 infected persons in the drug users in Liuzhou from 2011 to 2013 were randomly selected as the research objects,and the nucleic acid RNA was extracted from blood plasma,RT-PCR was used for gag and pol gene amplification,and the amplification products were given sequencing and sequential analysis.Results In the 16 cases of specimens,there were 2 HIV-1 subtypes,14 cases of reconstruction subtypes CRF01_AE(87.5%),and 2 cases of reconstruction subtypes CRF07_BC(12.5%),the related drug resistance mutation occurred to 6 strains,and NRTIs and NNRTIs related mutations were the main.Conclusion The HIV-1 infection of drug users in Liuzhou from 2011 to 2013 was mostly CRF01_AE,and the NRTIs and NNRTIs related mutations were the main.

HIV-1;Drug user;Gene subtype;Drug resistance

R52

A

1672-5654(2016)09(a)-0081-03

10.16659/j.cnki.1672-5654.2016.25.081

2016-05-25)

[课题资助]广西科学技术厅立项课题(项目编号:桂科攻1140003A-44);广西卫生厅资助课题(项目编号:Z2007289)。

陈柳军(1966.11-),男,广西柳州人,本科,副主任检验技师,研究方向:病原微生物检测。

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