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黄顶菊活性成分的构型及其除草活性作用机制

2016-07-25王俊敏冯涛赵影

江苏农业科学 2016年6期

王俊敏+冯涛+赵影

摘要:黄顶菊提取物中含有除草活性成分,针对这些活性基团合成一些具有除草活性的分子,采用B3lyp/6-311G(d,p)对7种化合物进行全参数优化,得到其稳定构型。并对化合物中原子的NBO电荷分布、前线分子轨道能级、静电势等性质进行了分析,结果表明,化合物的除草活性与分子的各种参数存在一定的联系,药物分子与受体作用时是噻吩环接受电子,苯环、吡啶环或嘧啶环提供电子,达到药物的作用效果,在药物分子发挥药效时主要是连在苯环、吡啶环或嘧啶环酰胺基这部分提供电子,与蛋白质或酶相互作用形成电子转移过程,从而达到除草效果。

关键词:黄顶菊;除草活性;量子化学研究;前线分子轨道

中图分类号: O621.13文献标志码: A文章编号:1002-1302(2016)06-0226-03

收稿日期:2015-12-14

基金项目:国家自然科学基金 (编号:31171877);河北省保定市科技局指导性计划(编号:13ZF080)。

作者简介:王俊敏(1978—),女,河北景县人,硕士,讲师,主要从事物理化学研究。E-mail:wang_jm12@163.com。黄顶菊也称为“生态杀手”,黄顶菊所分泌和释放的化感物质对马唐、反枝苋、棉花、玉米等具有很强的抑制作用。对黄顶菊的研究多集中于光合生理特性,而关于黄顶菊提取物的研究相对较少,已有报道表明黄顶菊的提取物具有杀虫活性[1-2]和杀菌抗病毒活性[3]。国内对黄顶菊的研究多集中于生物学、发生特点与危害等方面[4]。已经明确了外来入侵植物黄顶菊中具有较高除草活性的新型结构,并从黄顶菊的提取物中分离得到了活性较强的化感物质[5],笔者所在项目组通过分子设计和衍生合成了7种有机分子,并得到这些药物分子对油菜、马唐的除草活性数据。通过量子化学计算可以从理论上对药物的活性部位进行分析,为了明确这些药物的除草活性及作用机制,采用密度泛函理论(DFT) 中的B3LYP 方法,对化合物中原子的NBO电荷分布、前线分子轨道能级、静电势等性质与除草活性的关系进行了分析,阐明了这些分子的构效关系与作用机制,为进一步改造药物结构提供理论依据,而且也为除草剂的创新提供新的分子源,促进新型除草剂的研制。

1计算方法

计算使用Gaussview软件构建出7种待分析化合物的结构,运用密度泛函理论DFT/B3LYP方法,在6-311G(d,p)基组水平上,化合物进行分子的全参数几何优化,对计算结果的频率分析显示无虚频,说明已经得到能量最小的稳定构型[6]。全部计算工作用Gaussian03[7]程序完成。

2结果与分析

2.1优化后化合物的稳定构型及参数的选取

以分子经过优化后的稳定结构为基础,计算了各分子的NBO电荷,轨道能量,并从计算结果中提取出EHOMO(最高占据轨道能)、ELUMO(最低未占据轨道能量)、ΔE(轨道跃迁能,即ELUMO-EHOMO),分子的偶极矩、四级矩以及分子的药物活性数据列于表1中,各种轨道图以及分子的静电势图见图1。

2.2分子前线轨道能量分析

根据分子轨道理论及福井谦一的前线轨道理论,对分子活性影响最大的是最高占据轨道和最低未占据轨道,活性分子与目标分子反应时,主要是在分子前线轨道附近发生。农药分子的前线轨道能量对分子的活性有较大的影响,EHOMO过低或ELUMO过高都可能导致农药分子的活性过强,从而容易被分解或与其他受体作用,影响效果。所以,对于农药分子而言,EHOMO或ELUMO值应该在一定的范围内[8-9]。

从表1数据来看,EHOMO能级最高的是化合物3,化合物的供电子能力随着EHOMO能级的升高而增强,这就会使分子活性过强,从而在与受体作用时易被分解;ELUMO能级最高的是化合物1,化合物接受电子的能力随ELUMO能级的升高而减弱,当药物与受体作用时,化合物接受受体提供的电子较为困难。此分析结果与实验值相符。根据已经取得的活性数据,化合物5、化合物6的生物活性较高,这与量子化学计算结果相吻合,即化合物5、化合物6具有较低的EHOMO能级,且ΔE值相对较低,当药物分子与受体接触时,可以稳定地给受体提供电子,形成电子转移配合物,以保证药效的发挥。化合物2的ΔE值较高,为4.83,活性较低,这与活性数据相符合。从偶极矩和四级矩数据看出,其数据规律和前线轨道数据规律一致,分子的极性也是影响药物活性的因素。

图2是通过计算并绘制得到的这7种化合物的 HOMO、LUMO轨道图。从图2可以看出,分子的LUMO主要由噻吩环组成,HOMO多集中在苯环、吡啶环、嘧啶环上。这说明药物分子与受体作用时是噻吩环接受电子,苯环、吡啶环或嘧啶环提供电子,形成配合物,达到药物的作用效果。从 HOMO 轨道图上可以看出,化合物5、化合物6苯环上电子分布较多,所以活性较高。同时,也可以从轨道图上观察到,取代基种类和位置的不同对分子轨道的组成也有很大影响,从而影响药物活性。

2.3NBO电荷布局分析

表2中数据是7种化合物进行NBO计算后部分原子的自然原电荷分布,从结果可以看出,噻吩环呈负电性,可能与受体的正电性区域相结合,且7种化合物噻吩环上电荷分布基本相同,因此噻吩环对药物分子活性的影响不大。化合物1的吡啶环和其他化合物电荷相比负电性更强,化合物1对油菜的除草活性最强,所以吡啶环的NBO电荷对阔叶类的植物除草活性影响比较大;化合物3、化合物4和化合物1相比较,吡啶环上的氢原子被三氟甲基取代,化合物3的噻吩环上的氢原子还被烷氧羰基取代,由于三氟甲基和烷氧羰基均为强的吸电子基,降低了吡啶环上的电子密度,所以活性相比化合物1有所降低,在对油菜进行处理时,化合物3比化合物5的50%最大效应浓度低,可能是因为有烷氧羰基的存在,所以化合物1、3、4这3种药物分子对阔叶类植物的处理效果较好;化合物5和化合物6的苯环的NBO电荷最高,苯环上氢被氟原子取代,在处理马唐时所需剂量较少,所以氟原子的存在可能会对化合物活性有所提升,在处理尖叶植物时效果较好;化合物7中氮原子取代了苯环上的1个碳,在处理油菜时效果不如化合物4好。所以根据活性数据和分析可以得到如下结论:吡啶环和苯环上氟原子的引入对马唐的处理效果较好,含有活性基团吡啶环的分子对油菜有较好的处理效果,氢原子被三氟甲基取代后有助于油菜的处理。

2.4静电势分析

静电势是电子密度的反映,红色表明此处电子所处能级高,电子数量较大,易于给出电子。本研究中根据量子化学的计算结果,使用Gaussview绘制出几个化合物的静电势图(图3),从图3可以看出,酰胺基的羰基氧上的电荷密度较高,另外,在吡啶环、三氟甲基上也有较高的电荷密度,反应时主要是由这一部分给出电子。在静电势图上显示噻吩环呈蓝色,说明噻吩环上聚集了较多的正电荷,在与受体作用时,主要是接受受体提供的电子。在化合物3中,由于酯基和三氟甲基的强吸电子作用,导致在这一部分聚集了较多的负电荷,从而使化合物3在与受体作用时,由于活性较高,极易释放电子给受体,使该分子的活性受到影响。在化合物5、化合物6分子中,分别有氢被氟取代,因为氟有较强的电负性,使得在这2个原子附近聚集了小部分负电荷,容易提供电子给受体,从而发挥药效。

3结论

通过对目标化合物数据和能级图的分析,以及与活性数据的比较,可以得出以下结论:(1)这些药物分子的除草活性与分子的HOMO和LUMO分布,以及能量差ΔE密切相关,ΔE越小,除草活性较好,药物分子与受体作用时是噻吩环接受电子,苯环、吡啶环或嘧啶环提供电子,达到药物的作用效果。(2)吡啶环和苯环上氟原子的引入对马唐的处理效果较好,含有活性基团吡啶环的分子对油菜有较好的处理效果,氢原子被三氟甲基取代后有助于油菜的处理。(3)从静电势图上可以看出,连在苯环、吡啶环或嘧啶环酰胺基上显红色,为静电势负区,药物分子在发挥药效时主要是这部分提供电子,与蛋白质或酶相互作用形成电子转移过程,从而达到除草效果。

参考文献:

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