不同猪种肉质相关基因FTO多态性研究
2016-04-11马海明湖南农业大学动物科学技术学院湖南长沙410128
杨 攀,许 栋,马海明(湖南农业大学动物科学技术学院,湖南 长沙 410128)
不同猪种肉质相关基因FTO多态性研究
杨 攀*,许 栋,马海明**
(湖南农业大学动物科学技术学院,湖南 长沙 410128)
摘 要:为了研究肉质候选基因FTO(fat mass and obesity associated)在中外不同猪种群体中的遗传变异,本试验以杜洛克猪、大白猪、宁乡猪、大围子猪4个猪种为研究对象,运用PCR-RFLP的方法检测了FTO基因g.276G>T(AM931150)位点的基因频率和基因型频率。结果表明,宁乡猪、大围子猪的优势基因型均为GG,G是杜洛克猪、宁乡猪和大围子猪的优势等位基因,而大白猪的优势等位基因是T。本研究发现FTO基因的基因型分布在国外2个猪种群和地方猪种群之间存在较明显的差异,且这种差异极有可能是影响不同猪种肉质性状的原因之一,为以后更深入的研究打下了基础。
关键词:猪;肉质性状;FTO基因
FTO(fat mass and obesity associated)是脂肪肥胖相关基因,表达于人体各组织,且在下丘脑中高表达。FTO基因多态性与体重和肥胖症密切相关。FTO基因能够影响能量摄入及能量消耗,并通过多种途径诱导人群中肥胖症及2型糖尿病等相关疾病的发生。该基因位于猪的6号染色体上,包括9个外显子。本文研究了FTO基因的多态性,旨在寻找与猪肉质性状相关的遗传标记,为深入研究中外猪种的肉质形成机制奠定基础。
1 材料与方法
1.1 样品采集
杜洛克猪24头,大白猪28头,宁乡猪67头,大围子猪43头。剪少量耳组织,-20 ℃保存。
1.2 DNA的提取与PCR扩增
常规酚/氯仿抽提法提取基因组DNA。根据L. Fontanesi等(2008)设计引物扩增FTO基因第4内含子长度为397 bp的g.276G>T(AM931150)位点,该位点的左右引物为:5′-ACAGGCCCTGAAGAGGAAAG-3′;5′-AGTAACCTGGAGTTCCTGTGG-3′
PCR产物经Tai I限制性内切酶酶切后确定基因型。PCR反应体系为Green PCR Master Mix (2X) 12.5 μL,正反引物各0.8 μL,加ddH2O至25 μL,PCR反应程序为95 ℃预变性5 min,95 ℃变性30 s,60 ℃复性30 s,72 ℃延伸30 s,35个循环,72 ℃延伸5 min。酶切反应体系均为20 μL,其中PCR扩增产物10 μL,限制性内切酶2U,65 ℃消化4 h,酶切产物用2 %琼脂糖凝胶电泳后确定基因型。
2 结果与分析
2.1 FTO基因g.276G>T位点与PCR-RFLP
FTO基因g.276G>T(AM931150)位点T等位基因为397 bp,G等位基因为275 bp+122 bp,组成3种基因型,TT为397 bp,TG为397 bp+275 bp+ 122 bp,GG为275 bp+122 bp。
2.2 基因型频率与基因频率
杜洛克猪G等位基因频率为0.521,宁乡猪等位基因G的基因频率为0.881,大围子猪种G等位基因频率为0.942,而大白猪中等位基因T的频率为0.768。经Hardy-Weinberg平衡适合性检测表明,除宁乡猪此位点处于不平衡状态(P<0.01),其余均处于平衡状态(P>0.05,表1)。
3 讨论和结论
在猪肉质性状的研究中,有大量的报道表明FTO基因的g.276G>T(AM931150)位点与猪的肌内脂肪的沉积有很大的关系,而肌内脂肪含量是评价肉质的重要方面。经检测的杜洛克和大白猪都呈现出多态,本地猪种宁乡猪和大围子猪则几乎表现为单态,均为GG型,有少量的TG基因型出现,说明本地猪种在此位点上已开始存在少量变异。本研究发现FTO基因的基因型分布在国外2个猪种群和地方猪种群之间存在较明显的差异,且这种差异极有可能是影响不同猪种肉质性状的原因之一,这为以后更深入的研究提供了科学依据。□□
参考文献:(略)
*作者简介:杨攀(1993.9- ),汉族,湖南郴州市人,本科在读,E-mail:503634405@qq.com。
基金项目:863项目(2011AA100304-3)和湖南省自然科学杰出青年基金(13JJ1021)。
中图分类号:S813.1
文献标识码:A
文章编号:1001-0769(2016)02-0045-02
** 通信作者:E-mail: mahaiming2000@163.com。