实时荧光定量PCR在儿童肺炎支原体感染中的诊断价值
2015-03-09甘轶文毛李征俞海国
王 晶, 甘轶文, 毛李征, 俞海国
(1. 东南大学医学院附属南京同仁医院 儿科, 江苏 南京, 211102;
2. 南京医科大学附属南京儿童医院 风湿免疫科, 江苏 南京, 210008)
实时荧光定量PCR在儿童肺炎支原体感染中的诊断价值
王晶1, 甘轶文1, 毛李征1, 俞海国2
(1. 东南大学医学院附属南京同仁医院 儿科, 江苏 南京, 211102;
2. 南京医科大学附属南京儿童医院 风湿免疫科, 江苏 南京, 210008)
摘要:目的探讨实时荧光定量PCR(RTFQ-PCR)在儿童肺炎支原体(MP)感染中的诊断价值。方法选取106例肺炎患儿,采集静脉血,以间接荧光免疫法(IFA)检测MP-IgM表达;采集咽拭子标本,以RTFQ-PCR检测MP DNA拷贝数。以血清学检测结果为诊断标准,观察RTFQ-PCR诊断MP的灵敏度、特异度、阳性预测值和阴性预测值,及其在检测不同年龄段患儿MP感染中的准确性;比较MP-IgM阳性和阴性患儿的MP-DNA拷贝数差异。结果① RTFQ-PCR诊断灵敏度、特异度、阳性预测值和阴性预测值分别为90.48%、93.02%、95.00%、89.96%。绘制受试者工作曲线(ROC曲线),曲线下面积为0.740; ② RTFQ-PCR诊断6岁以上患儿MP感染的灵敏度和准确率高于1岁以下患儿(P<0.01); ③ MP-IgM阳性组DNA拷贝数对数显著高于阴性组拷贝数对数(P<0.01)。结论RTFQ-PCR诊断儿童MP感染具有较好的准确性,其荧光拷贝数越大越支持MP感染的诊断,对发病早期及年龄较大的患儿可能具有更高的诊断价值。
关键词:实时荧光定量PCR; 儿童; 肺炎支原体; 抗体
肺炎支原体(MP)是急性呼吸道感染的常见病原体,尤其是儿童肺炎的常见病原体[1],10%~30%的儿童社区获得性肺炎由MP引起,但在MP感染的肺炎与其他病原微生物感染的肺炎在症状、体征等临床特征方面并无特异性差异[2-3],难以早期、及时诊断,往往导致临床治疗中抗生素的滥用。直接检出病原体是诊断MP的金指标,但MP生长缓慢,分离培养条件较高,且培养耗时较长,临床应用收到诸多限制[4]。实时荧光定量PCR(RTFQ-PCR)可快速检测咽拭子标本中的MP-DNA,近年来在MP所致肺炎的诊断中得到了广泛应用[5]。本研究探讨了RTFQ-PCR检测肺炎患儿MP感染的准确度、特异度等,以期为临床诊断儿童MP感染提供参考,现报告如下。
1资料与方法
1.1 一般资料
选取2012年1月—2014年12月在东南大学医学院附属同仁医院治疗的肺炎患儿106例,均以咳嗽、发热为主要症状,胸片示片状阴影等肺炎特征,排除最近3 d内应用过大环内酯类药物的患儿[6]。其中男35例,女32例;年龄5个月~12岁,平均(5.24±1.48)岁;1岁以下24例,1~6岁44例,6岁以上38例。
1.2 方法
患儿均于入组时采集咽拭子标本,浸于1 mL无菌生理盐水中震荡,密封后-20 ℃冰箱保存,用以RTFQ-PCR检测MP DNA拷贝数,试剂盒购自通派(上海)生物科技有限公司。入组时采集静脉血,以间接荧光免疫法(IFA)检测MP-IgM表达。
1.3 观察指标
① 以IFA血清学检测结果为诊断标准,即双份血清MP抗体滴度升高4倍以上,或单份血清MP-IgM抗体阳性,且滴度≥1∶80诊断为MP感染,观察RTFQ-PCR诊断MMP的灵敏度、特异度、阳性预测值和阴性预测值,以及在检测不同年龄段患儿MP感染中的准确性。灵敏度=真阳性/(真阳性+假阴性)×100%, 特异度=真阴性/(真阴性+假阳性)×100%,阳性预测值=真阳性/(真阳性+假阳性)×100%, 阴性预测值=真阴性/(真阴性+假阴性)×100%; ② 比较MP-IgM阳性和阴性患儿的MP-DNA拷贝数差异。
2结果
2.1 RTFQ-PCR诊断结果
106例肺炎患儿中,IFA法检测出MP-IgM阳性63例,阴性43例;RTFQ-PCR检测出阳性60例(真阳性57例,假阳性3例),阴性46例(真阴性40例,假阴性6例)。以IFA检测结果为诊断标准,RTFQ-PCR诊断灵敏度为90.48%(57/63), 特异度为93.02%(40/43), 阳性预测值为95.00%(57/60),阴性预测值为86.96%(40/46)。
2.2 ROC下面积评价RTFQ-PCR对MPP的诊断价值
绘制ROC曲线, AUC=0.740, 表明RTFQ-PCR对MPP具有较好的诊断准确性。
2.3 RTFQ-PCR检测不同年龄段患儿MP感染的结果
RTFQ-PCR检测不同年龄段患儿MP感染的结果见表1,其中1岁以下诊断灵敏度为33.33%(2/6),特异度为77.78%(14/18), 准确率为66.67%(16/24); 1~6岁诊断灵敏度为96.00%(24/25), 特异度为94.73%(18/19), 准确率为95.45%(42/44); 6岁以上诊断灵敏度为100.00%(31/31), 特异度为85.71%(6/7), 准确率为97.37%(37/38)。3组比较,1~6岁和6岁以上患儿的诊断灵敏度及准确率均高于1岁以下患儿,差异有统计学意义(P<0.01),但1~6岁和6岁以上患儿之间差异无统计学意义(P>0.05)。
表1 RTFQ-PCR检测不同年龄段患儿MP感染的
2.4 MP-IgM阳性和阴性患儿MP-DNA拷贝数比较
根据血清学检测结果,将106例患儿分为MP-IgM阳性组和阴性组,分别对其PCR拷贝数取对数后进行比较,阳性组拷贝数对数为(5.78±2.03)log(MP-DNA)copy/mL, 阴性组拷贝数对数为(4.12±1.54)log(MP-DNA)copy/mL, 差异有统计学意义(P<0.01)。
3讨论
MP是儿童呼吸道感染的常见病原体,病原体培养是诊断金标准,但MP培养较困难,结果判定耗时需3~4周,因此,血清学MP抗体检测是目前临床应用的主要诊断方法[7-8],而在各抗体亚型中,只有IgM能提示早期感染[9],但MP-IgM通常出现于发病后1周,诊断依然存在延后性;且对免疫系统尚未发育完善的新生儿或存在免疫缺陷的患儿,血清学诊断方法存在一定局限性。
RTFQ-PCR是近年来被广泛应用的核酸检测技术,其在常规PCR的基础上增加了能识别扩增产物的探针,并以荧光标记,通过计算机实时描计产物扩增过程中的荧光曲线,并换算成DNA拷贝数,实现准确定量的目标。RTFQ-PCR操作方便,短时间内即可出结果,可显著减少扩增产物的污染机会,从而降低假阳性发生率,在成人和儿童MP感染的诊断中具有较大应用价值[10]。袁艺等[11]报道,在病程第1周,RTFQ-PCR诊断MP的敏感度和特异度分别为92.70%和93.3%,高于血清学检测,但随着病程的延长,血清学检测的敏感度显著升高,因此认为RTFQ-PCR更适合MPP的早期快速诊断。杨勇琼[12]也报道,社区活动性肺炎患者入院第1天,采用RTFQ-PCR的诊断率高于血清学诊断。樊茂等[13]对比了RTFQ-PCR和IFA检测小儿MP感染的阳性率,结果表明2种方法各有利弊,联合应用可提高早期检出率。一项纳入14篇文献的系统评价表明,PCR技术用于诊断MP感染的ROC曲线下面积>0.7,诊断准确率较好[14]。本研究结果表明,RTFQ-PCR检测儿童MP感染的灵敏度和特异度分别为90.47%和93.02%,绘制ROC曲线计算AUC为0.740, 高于张晓波等[15]报道的AUC(0.641); 比较不同年龄段患儿的检出率,结果表明6岁以上患儿的诊断灵敏度高于1岁以下患儿,差异有统计学意义(P<0.01); 6岁以上患儿的诊断准确率高于其他年龄段患儿,但差异无统计学意义(P>0.05), 这可能与样本量较小有关。此外,MP-IgM阳性组DNA拷贝数显著高于阴性组DNA拷贝数,提示RTFQ-PCR检测为阳性的时间可能较血清学抗体检测出现阳性更早,PCR拷贝数越大越能支持诊断结果。因此,对高度怀疑MP感染的患儿,在发病早期即可行RTFQ-PCR检测,结果为阳性且拷贝数较大的患儿,可在发病1周后进一步检测血清抗体,提高诊断准确率。
参考文献
[1]陈志敏. 儿童肺炎支原体感染诊治研究进展[J]. 临床儿科杂志, 2008, 26(7): 562.
[2]Youn Y S, Lee K Y. Mycoplasma pneumoniae pneumonia in children[J]. Korean journal of pediatrics, 2012, 55(2): 42.
[3]Wang K, Gill P, Perera R, et al. Clinical symptoms and signs for the diagnosis of Mycoplasma pneumoniae in children and adolescents with community-acquired pneumonia[J]. The Cochrane Library, 2012, doi: 10.1002/14651858.CD009175.pub2.
[4]董燕芬, 马玲娣. 肺炎支原体检测及临床应用进展[J]. 国际检验医学杂志, 2010, 31(3): 269.
[5]Thurman K A, Warner A K, Cowart K C, et al. Detection of Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae, and Legionella spp. in clinical specimens using a single-tube multiplex real-time PCR assay[J]. Diagn Microbiol Infect Dis, 2011, 70(1): 1.
[6]Yamada M, Buller R, Bledsoe S, et al. Rising rates of macrolide-resistant Mycoplasma pneumoniae in the central United States[J]. Pediatr Infect Dis J, 2012, 31(4): 409.
[7]Smith-Norowitz T A, Silverberg J I, Kusonruksa M, et al. Asthmatic Children Have Increased Specific Anti-Mycoplasma pneumoniae IgM but not IgG or IgE—Values Independent of History of Respiratory Tract Infection[J]. Pediatr Infect Dis J, 2013, 32(6): 599.
[8]Lee K, Kim W J, Kim D L, et al. Seroprevalences of Mycoplasma pneumoniae IgM Antibodies among Children Living in Jeju Island, Korea[J]. LMO, 2014, 4(3): 146.
[9]张健, 李莉, 王文龙, 等. 肺炎支原体抗体分型检测和被动颗粒凝集检测结果比较[J]. 中华检验医学杂志, 2012, 35(7): 639.
[10]Qu J, Gu L, Wu J, et al. Accuracy of IgM antibody testing, FQ-PCR and culture in laboratory diagnosis of acute infection by Mycoplasma pneumoniae in adults and adolescents with community-acquired pneumonia[J]. BMC infectious diseases, 2013, 13(1): 172.
[11]袁艺, 伏瑾, 曹玲, 等. 肺炎支原体荧光定量聚合酶链反应检测在儿童肺炎支原体肺炎中的诊断意义[J]. 实用儿科临床杂志, 2009, 24(10): 760.
[12]杨勇琼. 支原体肺炎早期诊断中荧光定量PCR优于血清学试验[J]. 中国实用医药, 2012, 7(29): 3.
[13]樊茂, 张倩. 两种方法检测肺炎支原体感染的比较[J]. 国际检验医学杂志, 2012, 33(5): 586.
[14]陆爱珍, 王立波. PCR技术用于诊断肺炎支原体感染的系统评价[J]. 临床儿科杂志, 2007, 25(4): 312.
[15]张晓波, 陆爱珍, 王立渡, 等. 肺炎支原体荧光定量聚合酶链反应在肺炎支原体感染中的诊断评价[J]. 中华儿科杂志, 2008, 46(6): 442.
技术与方法
The diagnostic value of real-time PCR in children with
mycoplasma pneumoniae infection
WANG Jing1, GAN Yiwen1, MAO Lizheng1, YU Haiguo2
(1.DepartmentOfPediatrics,NanjingTongrenHospitalAffiliatedtoMedicalSchool
ofSoutheastUniversity,Nanjing,Jiangsu, 211102; 2.DepartmentofRheumatology,
NanjingChildren′SHospitalAffiliatedtoNanjingMedicalUniversity,Nanjing,Jiangsu, 210008)
ABSTRACT:ObjectiveTo explore the diagnostic value of real-time quantitative PCR (RTFQ-PCR) in children with mycoplasma pneumoniae (MP) infection. MethodsTotally 106 children with pneumonia were choosed and venous blood was collected. Indirect fluorescence immunoassay (IFA) were applied to detected MP-IgM expression. RTFQ-PCR was used to determine the MP DNA copies collected from throat swab specimens. Diagnostic sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value of RTFQ-PCR as well as detection accuracy among different ages were observed according to diagnostic criteria serological test. Meanwhile the differences of MP-DNA copies between MP-IgM positive and negative children was compared. Results① Diagnostic sensitivity, specificity, positive predictive value and negative predictive value of RTFQ-PCR were 90.48%, 93.02%, 95.00%, 89.96% respectively. Receiver operating characteristic curve was analysed and the area under the curve was 0.740. ② Sensitivity and accuracy of RTFQ-PCR in MP children over 6 years old were higher than in children under 12 months (P<0.01). ③ Logarithm of DNA copies in MP-IgM positive children was significantly higher than that in MP-IgM negtive children (P<0.01). ConclusionRTFQ-PCR diagnosis of MP infection in children has a favorite accuracy. The greater the fluorescent of copies are, the support with the diagnosis of MP infection goes up. It may have a higher diagnostic value in early onset and older children.
KEYWORDS:mycoplasma pneumonia; real-time quantitative PCR; children; antibody
通信作者:毛李征, E-mail: maolz@njtrh.org
收稿日期:2015-04-03
中图分类号:R 563.1
文献标志码:A
文章编号:1672-2353(2015)15-091-03
DOI:10.7619/jcmp.201515027