Taq DNA聚合酶的制备和纯化
2013-09-04詹庆才詹祎捷刘之熙朱克永
詹庆才,詹祎捷,刘之熙,朱克永
(1.湖南省水稻研究所,湖南 长沙 410125;2.北京联合大学应用文理学院,北京 100083)
PCR技术被广泛应用于分子生物学、食品科学、医学等相关研究领域。作为PCR技术的主要试剂的Taq DNA聚合酶用量日益增多。而目前大多数实验室主要依赖公司商品化的Taq DNA聚合酶。为了降低研究和开发成本,一些实验室利用不同的分离纯化方法生产Taq DNA聚合酶[1-4]。湖南省水稻研究所生物技术室利用含Taq DNA聚合酶基因的p Taq表达质粒转化大肠杆菌E.coli菌株,诱导表达耐热Taq DNA聚合酶,然后提取纯Taq DNA聚合酶,并用考马斯亮蓝法和PCR分析其纯度、浓度和活性。该技术旨在制备Taq DNA聚合酶,降低分子生物学实验成本。
1 材料与方法
1.1 材 料
含Taq酶基因的载体p Taq由中国科学院遗传与发育研究所提供,氨苄青霉素(Amp)、溶菌酶、苯甲基磺酰氟(PMSF)、异丙基硫代-b-D-半乳糖苷(IPTG)、Taq DNA 聚合酶、DNA Marker等生物化学试剂购自鼎国生物科技有限公司。
1.2 方法
1.2.1 外源基因在大肠杆菌中的表达 取出菌种,将少许的冰冻菌种培养物在LB平板(含Amp100 mg/mL)上划线,37℃培养 16~20 h。挑取单菌落接种到6 mL含100 mg/mL氨苄青霉素的LB培养基中,37℃振荡培养过夜;用1.25 mL过夜培养的菌种接种到250 mL的LB液体摇瓶中(Amp终浓度为100 mg/mL),37℃培养4.5 h;在总量1 000 mL的培养液中加入120 mg的IPTG诱导(终浓度为0.5 mmol/L)。培养液在37℃,继续培养16~20 h。
1.2.2 重组Taq DNA聚合酶的提取 3 000 g离心20 min收集菌体,每1 000 mL菌液离心后加入60 mL(30 mL×2)溶液 A(50 mmol/L Tris-HCl pH值 8.0;50 mmol/L Dextrose (glucose);1 mmol/L EDTA)中重悬;将收集菌体洗,7 000 g离心10 min重新收集菌体。菌体再悬在40 mL(20 mL×2)溶液A中,混匀。加入终浓度为4 mg/mL的lysozyme(Sigma),室温(25℃)放置 15 min。加入 40 mL的溶液B(10 mmol/L Tris-HCl pH值 8.0;50 mmol/L KCl;1 mmol/L EDTA (pH 值 8.0);1 mmol/L PMSF;0.5%Tween 20;0.5%NP-40),75℃水浴保温1 h,期间要晃动几次。4℃,10 000 g离心20 min重新收集上清液。上清液中加入5%PE(I聚乙烯亚胺),使终浓度为0.15%(体积比),加入时用磁力搅拌器搅拌,慢慢地逐滴加入。室温下继续搅拌10 min。4℃,10 000 g离心15 min重新收集沉淀。用24 mL的含25 mmol/L KCl的溶液C(20 mmol/L Hepes pH 值 7.9;1 mmol/L EDTA(pH 值 8.0);0.5 mmol/L PMSF;0.5%Tween 20;0.5%NP-40)再悬,并洗涤沉淀。4℃,7 000 g离心15 min,收集沉淀。用24 mL含150 mmol/L KCl的溶液C再悬沉淀。4℃,2 500 g离心10 min,收集上清液。测量收集上清液的体积,使收集的上清液最终KCl的浓度为50 mmol/L(通过加入2倍体积的不含KCl的溶液C)。此时即完成了上柱前样品的准备。
1.2.3 重组Taq DNA聚合酶的纯化 称取7 g Bio-Rex 70的干树脂,放在小烧杯中,用双蒸H2O洗,去掉漂浮的小颗粒,室温溶胀2 h,期间换几次双蒸H2O。用含50 mmol/L KCl的溶液C预平衡,装层析柱。装好树脂后再用6~10倍柱床体积的含50 mmol/L KCl的溶液C平衡柱子。检查进入柱子和流出柱子的溶液C的pH值不变,将样品装在平衡好的层析柱上。
层析柱用6倍体积(约60 mL)以上的含50 mmol/L KCl的溶液C再次平衡。样品用含200 mmol/L KCl的溶液C洗脱。一般准备50 mL洗脱液,以3 mL体积在试管中分部收集。将含Taq酶较集中的分部收集在一起,放在透析袋中。用500 mL溶液 D(20 mmol/L Hepes pH 值 7.9;100 mmol/L KCl;0.1 mmol/L EDTA;0.5 mmol/L PMSF;1 mmol/L DTT;50%glycerol),4℃透析 20 h 左右,期间换一次透析液。透析后得到约2~3 mL的酶液。从透析袋中取出酶液,立即与20 mL溶液D混合,储存在-20℃以下,以保持酶的长期稳定性。
1.2.4 重组Taq DNA聚合酶的活性测定 PCR扩增反应检查所纯化的Taq DNA聚合酶的活力,以目前实验室所用的Taq DNA聚合酶商品酶为对照。PCR反应在10μL的反应体积中进行,包含1 μmol引物,1 μL DNA 样品(10 ng),0.5单位市售Taq DNA聚合酶或0.1μL自制的Taq DNA聚合酶,1μLlO倍PCR反应液(100 mmol/L Tris-HC1,pH 值 8.3;15 mmol/L MgCl2,500 mmol/L KC1,质量分数为0.01%的明胶)。所用引物为:正向序列5’-TGCCCTGTTATTTTCTTCTCTC-3’;反向序列:5’-GGTGATCCTTTCCCATTTCA-3’。
扩增反应条件为:94℃变性4 min,然后是94℃ 30 s,55℃ 30 s,72℃ 1 min,进行 35 个循环,最后72℃延伸7 min。反应采用96孔PCR盘在PE公司9700型基因扩增仪上进行。扩增产物在质量浓度为4%的Nusieve 3∶1琼脂糖凝胶上进行电泳分离,溴化乙锭染色,紫外光下观察拍照。
2 结果与分析
2.1 重组Taq DNA聚合酶分离纯化的结果
用3 mL的离心管分部收集层析分离的Taq DNA聚合酶,在SDS-PAGE上电泳,以购买的Taq DNA聚合酶做对照。确定哪个部分含Taq DNA聚合酶和含量的多少,根据电泳结果判断酶的制备是否成功。一般Taq DNA聚合酶在第3、4、5个分部中被洗脱下来。
2.2 重组Taq DNA聚合酶的活性
利用等量的分离纯化的重组Taq DNA聚合酶与市售的Taq DNA聚合酶同时进行PCR扩增。结果表明,自制重组Taq DNA聚合酶与市售重组DNA聚合酶有相似的活性,都可扩增出目的DNA片段,等量自制重组Taq DNA聚合酶和市售产品扩增出的DNA量相同(图1),说明自制产品与市售产品有相似的比活性。
3 讨论
重组DNA Taq DNA聚合酶的分离纯化有硫酸铵沉淀法[1,5-6]、利用 Ni柱亲和色谱法[2]、AKTA 蛋白纯化系统[3]及冻溶法[4]等方法。研究利用Taq DNA聚合酶耐热性强的特点,采用溶菌酶、NP40裂解细菌热变性沉淀杂蛋白,Bio-Rex 70柱层析透析,克服了溶冻法、硫酸铵沉淀法不能充分除去杂蛋白,AKTA蛋白纯化系统虽然能得到高质量的产品,但成本较高。通过优化分离纯化条件,得到了高纯度的重组Taq DNA聚合酶,且保持了很高的活性,制备的Taq DNA聚合酶完全能满足分子生物学实验的要求。
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