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Nature:蛋白结构分析的新里程碑

2013-03-25

生物工程学报 2013年12期
关键词:膜蛋白溶菌酶X射线

利用X射线晶体学技术研究蛋白质结构,需要用许多已知数据来填补数据的缺口。而现在,科学家们应用X射线新技术,从头解析了蛋白质的准确结构,构建了该蛋白的完整3D模型,这是蛋白结构分析的一个重要里程碑。

溶菌酶(Lysozyme)是一种已经被广泛研究的蛋白。日前,美国能源部(DOE)SLAC国家加速器实验室的研究人员,使用直线加速器相干光源LCLS(Linac Coherent Light Source)和复杂的计算机分析工具,从头生成了溶菌酶的准确模型。这项研究于11月24日发表在Nature杂志上。

一直以来,由于许多重要蛋白的结晶体太小,传统的X射线技术难以对其进行分析。而LCLS的特殊性质能够帮助人们解析更小的结晶体,揭示更多重要的蛋白质结构。

在用X射线技术确定蛋白结构时,需要综合海量数据以获得足够准确的信号,对于缺乏参考数据的蛋白来说,并不那么实用。“现在我们的实验显示,新X射线技术可以从头展现未知生物结构的确切信息。”马普医学研究所的科学家Thomas Barends说。

蛋白的结构直接决定着它们的功能(例如,蛋白与其他分子的结合/相互作用),蛋白结构分析能够为人们提供重要信息,帮助人们开发高度靶向性的治疗药物。迄今为止,人们所了解的蛋白结构大多离不开X射线晶体学技术。一个世纪以来,许多诺贝尔奖成果都得益于这一技术。

早在数十年前,人们就解析了溶菌酶的结构。现在研究人员利用这一蛋白,来考量新X射线技术的准确性。他们将溶菌酶晶体浸泡在含有钆的溶液中,这种金属与溶菌酶结合,能够在X射线的照射下产生强信号。研究者们利用钆原子的这种信号,对溶菌酶分子的结构进行了准确的重建。

研究团队准备进一步调整和改善这一技术,将其应用于更多更复杂的蛋白质,如膜蛋白。膜蛋白承担了大量的重要细胞功能,是新药研发中的重要靶标,然而人们目前只知道少数膜蛋白的结构。

“这项研究是一个重要的里程碑,”曼彻斯特大学的化学教授 John R. Helliwell说。“X射线技术迎来了新的机遇,可以解析更小样本的3D结构,这一点令人鼓舞。”

LCLS在短短几年的应用中,就获得了如此成就,Barend相信“X射线检测设备、相关软件以及结晶技术的进一步发展,定会在不久的将来催生更多的新成果”。

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