APP下载

31例B型血友病患者凝血因子Ⅸ基因突变研究

2012-09-27刘丹娟李莉艳罗深秋

重庆医学 2012年12期
关键词:血友病内含子外显子

刘丹娟,李莉艳,李 强,孙 竞,钟 梅,罗深秋△

(南方医科大学:1.细胞生物学教研室/骨与软骨再生重点实验室;2.南方医院妇产科;3.南方医院检验科;4.南方医院血液科,广州 510515)

血友病是一组X连锁隐性遗传的出血性疾病,临床上常见的有A型血友病(HA)和B型血友病(HB)两型,分别是由于凝血因子(F)Ⅷ和FⅨ基因突变所引起。在男性血友病患者中,HA占80%~85%,而HB仅占15%~20%,在男性中的发病率大约为1/30 000[1],女性患者罕见。HB基因突变具有明显的异质性,可发生在FⅨ基因外显子、内含子、启动子及其侧翼序列的任何位置[2]。目前已知的FⅨ基因突变类型包括点突变、缺失、插入等。

本研究利用PCR法及DNA测序技术对31例HB患者进行FⅨ基因突变检测,对于明确FⅨ基因突变机制有重要意义,且丰富了FⅨ基因突变谱。

1 资料与方法

1.1 一般资料 31例HB患者均来自本院血液科及妇产科门诊,FⅨ活性测定均小于5%。

1.2 研究方法 采集HB患者外周血2mL,以乙二胺四乙酸(EDTA)抗凝,采用外周血DNA提取试剂盒(美国Life公司)提取DNA。根据FⅨ基因序列(Gene Bank K02402),参照文献[3]设计并合成8对扩增引物(表1),引物由上海英骏生物技术有限公司合成。

PCR反应总体积为50μL,加入上游和下游引物各5pmol(终浓度为0.1μmol/L),4种dNTP各5nmol(终浓度为0.1 mmol/L),5μL 10×Taq PCR Buffer(100mmol/L Tris-HCl,15mmol/L MgCl2和 500mmol/L KCl,pH 8.3),2U Taq DNA聚合酶(TAKARA公司),基因组DNA 50~200ng。PCR反应在美国PE公司的9700型热循环仪上进行。测序工作由上海英骏生物技术有限公司完成。

表1 引物序列

续表1 引物序列

2 结 果

31例HB患者通过DNA测序均检测到了突变位点。检测结果显示,FⅨ基因的突变位点分散无热点区,突变类型也不同。本研究中共发现了34种突变,其中1例为三重突变,6例为双重突变,此外还发现13种新突变。31例HB患者均发现基因突变,其基因突变发生的碱基改变、具体部位(基因碱基序列编号采用Yoshitake方法[4])、引起的氨基酸变化和是否为CpG突变热点见表2。

表2 31例HB患者FⅨ基因突变

续表2 31例HB患者FⅨ基因突变

3 讨 论

FⅨ基因定位于Xq27.1,基因全长约33.5kb,由8个外显子、7个内含子及其侧翼序列中的调控区所组成[5],mRNA全长2 804bp。FⅨ基因任意位置的缺陷引起蛋白结构功能和数量的改变,均可导致HB的发生。

HB基因突变类型种类繁多,以点突变、短片段的缺失(少于30bp)和插入突变多见,其中80%左右为单个碱基的突变[6]。不同于 HA,HB的散发率可达30%~50%[7]。1990年Brownlee首次建立了HB突变数据库。随着病例数目的积累,新的缺陷正不断地被发现。从已报道的突变分布看,包括polyA信号在内的FⅨ基因所有区域均有突变发生。本研究除外6例缺失(一例全基因缺失和5例短片段缺失),其余均为点突变,占80.6%。由于编码与Ca2+结合的EGF区及催化区,外显子4和8的突变发生率较高[8]。本研究中的31例患者,有11例发生于外显子4和8,占35.5%。而外显子1、6、7中突变较少,共占19.4%。

CpG双核苷酸区域被认为是突变热点[9-10],刘敬忠等[11]采用PCR法和GAWTS技术也进一步证实了CpG确系突变热点,主要是(C→T/A)。研究中有7例发生在CpG热点上,类型为(C→T),(G→A)和(G→T),占22.6%。

Toyozumi等[12]确定了内含子1的第192核苷酸(FⅨ192)为二核苷酸多态性位点,存在于健康日本人中。王宁遂等[13]发现并计算出中国人FⅨ-192A和G的基因频率分别为0.81和0.19。本研究中有4例患者的突变发生于此处,进一步验证了该基因此位置的多态性。2例患者只检测出此惟一多态性位点需进一步检测未测序列,以确定致病突变位点。

经过最新的血友病B数据库资料查询,本研究共发现13种新突变,为国际上首次报道。其中4种为发生在外显子的错义突变,氨基酸改变分别为L-Q、Y-D、S-P和 V-G。除了-T为已报道的导致阅读框架移位的突变点外,其余3种均为新发现的缺失突变类型,其中-GCTGAAACCA和-GCTAAACA引起阅读框架移位,根据剪切位点的位置判断[14],-ATTT为剪接位 点 缺 失。此 外,T6320A、C6828T、G6640A、A29753G、G30321T和T17517G等6种突变发生于内含子部位,已知6320为剪切位点,可确定T6320A为致病突变,其余5种突变是否为一种新的多态性或者为致病突变,则需要进一步研究。

本文报道了31例HB患者FⅨ基因突变的研究,对临床进行HB携带者筛查及产前基因诊断具有重要的参考和指导意义。而FⅨ基因新突变的发现,在丰富HB基因突变谱的同时,还有助于进一步了解FⅨ基因中某些氨基酸残基对于FⅨ凝血活性的重要性,为明确HB的分子致病机制提供了实验数据。

[1] Giannelli F,Green PM,High KA,et al.Haemophilia B:database of point mutations and short additions and deletions-third edition[J].Nucleic Acids Res,1992,20(Supp l):2027-2063.

[2] 段宝华.血友病B患者及其携带者基因诊断新进展[J].国外医学临床生物化学与检验学分册,2002,23(3):133-134.

[3] Vidal F,Farssac E,Altisent C,et al.FactorⅨ gene sequencing by a simple and sensitive 15-hour procedure for haemophilia B diagnosis:identification of two novel mutations[J].British J Haematol,2000,111(21):549-551.

[4] Yoshitake S,Schach BG,Foster DC,et al.Nucleotide sequence of the gene for human factor(antihemophilic factor B)[J].Biochemistry,1985,24(3):3736-3750.

[5] Bowen D.Haemophilia A and haemophilia B:molecular insigIlt8[J].Mol Patllol,2002,55(2):127-144.

[6] Garmen E,Pilar C,Satumino H,et al.Molecular analysis in hemophilia B families:identification of six new mutations in factorⅨgene[J].Haematologiea,2003,88(101):235-236.

[7] Mukherjee S,Mukhopadhyay A,Chaudhuri K,et al.Analysis of haemophilia B database and strategies for identification of common point mutations in the factorⅨgene[J].Haemophilia,2003,9(13):187-192.

[8] 张媛,杨林花,陆晔玲,等.应用DNA测序技术检测血友病B患者FⅨ基因突变[J].中国实验血液学杂志,2009,17(2):476-478.

[9] 刘敬忠,向华,刘亮,等.应用基因扩增转录技术诊断乙型血友病[J].中华医学杂志,1995,75(10):599-601.

[10]王宁遂,邓兵,朱静.应用多聚酶链反应和双链DNA循环测序对FⅨ基因点突变的研究[J].中华血液学杂志,1995,16(5):227-228.

[11]刘敬忠,张纪平,陈怀华,等.27例乙型血友病患者Ⅸ因子基突变研究[J].高技术通讯,1994,4(3):29-32.

[12]Toyozumi H,Kojima T,Matsushita T,et al.Diagnosis of hemophilia B carriers using two novel dinucleotide polymophisms and HhaI RFLP of the factorⅨgene in Japanese subjects[J].Thromb Haemost,1995,74(4):1009-1014.

[13]王宁遂,邓兵,朱静.一种FⅨ基因多态性在我国人群中的检出[J].中华医学遗传学杂志,1994,11(4):217-218.

[14]Ketterling RP,Drost JB,Scaring WA,et al.Reported in vivo splice-site mutations in the factorⅨ gen severity of splicing defects and a hypothesis for predicting deleterions splice donr mutation[J].Human Mutation,1999,13(7):221-231.

猜你喜欢

血友病内含子外显子
外显子跳跃模式中组蛋白修饰的组合模式分析
线粒体核糖体蛋白基因中内含子序列间匹配特性分析
外显子组测序助力产前诊断胎儿骨骼发育不良
不同方向内含子对重组CHO细胞中神经生长因子表达的影响
更 正
外显子组测序助力产前诊断胎儿骨骼发育不良
内含子的特异性识别与选择性剪切*
51例血友病患者家庭注射调查分析
新生儿甲型血友病的护理1例
血友病患者健康状态评定