XRCC1和XRCC3单核苷酸多态性与晚期非小细胞肺癌铂类药物化疗疗效的相关性
2011-09-11许崇安王小杰张晔李琳
许崇安 王小杰 张晔 李琳
铂类药物(顺铂或卡铂)是治疗非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer, NSCLC)的重要药物,其与长春瑞滨、吉西他滨、紫杉醇、多西他赛任一联合的两药方案对NSCLC患者化疗的有效率相似[1],与非铂类方案相比,含铂两药方案化疗能够延长NSCLC患者的生存期,并提高其生活质量[2],含铂两药方案现已成为治疗进展期NSCLC的标准一线方案。铂类药物主要通过损伤DNA而导致细胞死亡[3],而机体的DNA损伤修复系统可以修复这类损伤,从而影响铂类药物化疗的敏感性。由于个体之间对DNA损伤后的修复能力有很大的差异[4,5],因此,常可导致即使同样是NSCLC,甚至是病理类型和临床分期相同的患者采用相同的治疗方案,其治疗效果和不良反应却明显不同。DNA修复基因的过表达及DNA修复基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)可改变DNA修复能力,因此,检测DNA修复基因的SNP可以预测个体肿瘤化疗的敏感性和预后。
X线修复交错互补基因1(X-ray repair cross complementing gene 1, XRCC1)是DNA碱基切除修复和单链断裂修复系统中的重要成分,参与铂类药物等引起的DNA修复过程,该基因编码区存在导致氨基酸取代的SNP,这些SNP影响XRCC1的活性[6,7]。虽然许多功能性研究已报告了XRCC1对肿瘤的影响,但其SNP与NSCLC铂类药物化疗敏感性关联的研究结果却不尽相同。X线修复交错互补基因3(X-ray repair cross complementing gene 3, XRCC3)是Rad51 DNA修复基因家族成员,虽然在DNA双链断裂同源性重组修复中扮演重要角色[8],但其Thr241Met位点的SNP与铂类药物化疗敏感性的关系尚不清楚。本研究报告130例晚期NSCLC患者XRCC1和XRCC3的SNP以及它们与铂类药物化疗疗效的关系,为个体化化疗提供依据。
1 材料与方法
1.1 研究对象 2008年8月-2010年3月中国医科大学附属第四医院收治的经病理证实的初治晚期NSCLC患者130例,其中男性90例,女性40例,均为汉族;中位年龄62(28-83)岁;吸烟80例,不吸烟50例;腺癌76例,鳞癌46例,其它类型8例;临床分期:IIIb期58例,IV期72例;ECOG PS评分:0分44例,1分86例。所有患者均有可测量病灶并均接受了2个-6个周期(平均4个周期)含铂两药方案化疗。具体化疗方案如下:长春瑞滨+铂类(顺铂或卡铂)82例,吉西他滨+铂类26例,紫杉醇类(紫杉醇或多西他赛)+铂类22例。
1.2 样本收集 血液标本在患者知情同意的情况下,于化疗前抽取静脉血5 mL,静置后取血凝块并提取DNA,将提取的DNA置于-20oC低温冰箱中备用。
1.3 疗效评定 所有患者均经含铂两药方案化疗2个周期后根据RECIST标准评定疗效,分为完全缓解(complete response, CR)、部分缓解(partial response, PR)、疾病稳定(stable disease, SD)和疾病进展(progressive disease,PD)。客观缓解=CR+PR,未缓解=SD+PD。
1.4 基因型分析 采用PCR-RFLP方法进行XRCC1、XRCC3基因型检测。引物序列及扩增片段大小见表1。25 μL PCR反应混合液中含1 μL DNA、0.4 μmol/L引物各1 μL、0.1 mmol/L dNTP 2 μL、Taq聚合酶0.125 U、5×反应缓冲液5 μL。PCR反应条件: 95oC预变性5 min;95oC 45 s,61oC 45 s,72oC 45 s,35个循环;72oC延伸10 min。分别取5 μL PCR产物与相应的核酸内切酶37oC温育过夜,XRCC1 Arg194 Trp、Arg399 Gln及XRCC3 Thr241 Met核酸内切酶分别为PvuII、NciI和NlaIII。3.0%琼脂糖凝胶电泳分析酶切产物。随机抽取30%样本,双盲法重复检测加以验证,结果完全一致。
1.5 统计分析 应用SPSS 17.0进行统计学分析,采用χ2检验或Fisher's精确概率法比较不同基因型之间化疗疗效的差异,采用非条件Logistic回归分析计算优势比(odds ratio,OR)及其95%可信区间(confidence interval, CI)评价不同基因型及多态位点间联合与疗效的相关性。所有检验均为双侧,P<0.05为差异有统计学意义。
2 结果
2.1 疗效分析 130例晚期NSCLC患者经含铂两药方案化疗2个周期后,CR 0例,PR 44例(33.8%),SD 54例(41.6%),PD 32例(24.6%),化疗总有效率为33.8%(44/130)。
2.2 基因分布 130例晚期NSCLC患者,在XRCC1 Arg-194Trp位点中,携带Arg/Arg、Arg/Trp和Trp/Trp基因型患者分别为54例(41.5%)、40例(30.8%)和36例(27.7%)。在XRCC1 Arg399 Gln位点中,携带Arg/Arg、Arg/Gln和Gln/Gln基因型患者分别为66例(50.8%)、54例(41.5%)和10例(7.7%)。在XRCC3 Thr241 Met位点中,携带Thr/Thr和Thr/Met基因型患者分别为114例(87.7%)和16例(12.3%),未检测到Met/Met纯合突变基因型。
2.3 基因型与化疗疗效的关系 从表2可见,携带XRCC1 194 Arg/Arg、Arg/Trp和Trp/Trp基因型NSCLC患者的化疗有效率分别为22.2%、35.0%和50.0%,有明显差异(χ2=7.478, P=0.024)。携带Trp/Trp基因型患者的化疗有效率是Arg/Arg基因型携带者的3.5倍(P=0.006)。携带至少1个Trp等位基因(Arg/Trp和Trp/Trp基因型)患者的化疗有效率至少是携带Arg/Arg基因型患者的2.5倍(P=0.018)。携带XRCC1 399 Arg/Arg、Arg/Gln和Gln/Gln基因型患者的化疗有效率分别为45.5%、25.9%和0,携带XRCC1 399 Arg/Arg基因型患者的化疗有效率明显高于其它基因型携带者。携带XRCC3 241 Thr/Thr与Thr/Met基因型患者化疗有效率分别为31.6%和50.0%,二者无统计学差异(P=0.145)。
年龄、性别、吸烟、病理类型及临床分期与晚期NSCLC患者化疗敏感性均无统计学关联(P>0.05)。
2.4 XRCC1 Arg194 Trp和Arg399 Gln多态联合作用与化疗疗效的关系 我们进一步分析了XRCC1 Arg194 Trp和Arg399 Gln两个位点基因型联合与化疗疗效的关系,结果显示,XRCC1 194和399多态之间在化疗敏感性方面存在明显相互作用,同时携带XRCC1 194Arg/Arg和399Gln/Gln基因型的10例患者无一例有效,而携带至少1个XRCC1 194 Trp等位基因同时又携带XRCC1 399 Arg/Arg基因型者的化疗有效率明显高于同时携带194 Arg/Arg和399 Arg/Gln基因型者(表3)。
2.5 XRCC1与XRCC3联合基因型与化疗疗效的关系 本研究进一步分析了XRCC1与XRCC3两个基因不同多态基因型联合与化疗敏感性的关系,发现XRCC1与XRCC3多态之间在化疗敏感性方面存在明显的相互作用;携带至少1个XRCC1 194 Trp等位基因和399 Arg/Arg野生型基因同时又携带XRCC3 241 Thr/Met基因型者的化疗有效率明显高于其它基因型携带者(表4)。
3 讨论
人类细胞中存在大量DNA修复基因,它们对某些类型的DNA损伤具有特异性修复能力,对避免基因突变、维护基因组的稳定性和完整性具有重要的作用。许多DNA修复基因具有SNP,导致氨基酸替代的SNP可能改变修复酶的活性,并且可能是导致个体DNA损伤修复能力差异的重要原因[9]。研究[10]表明,DNA修复能力与肿瘤易感性密切相关,DNA修复能力低肿瘤易感性高;而在肿瘤治疗过程中,DNA修复能力的增加却阻碍了疗效的发挥,肿瘤细胞的DNA修复能力与化疗敏感性密切相关。
XRCC1的SNP可影响XRCC1蛋白的正常功能,从而影响DNA修复能力[11]。XRCC1 SNP与铂类药物化疗敏感性相关,携带XRCC1 194 Trp等位基因的NSCLC患者对铂类药物化疗敏感,而携带Arg/Arg基因型患者对铂类药物化疗失败的风险几乎是携带至少1个Trp等位基因患者的3倍。携带至少1个XRCC1 399 Gln等位基因的患者对铂类药物化疗失败的风险是399 Arg/Arg携带者的2.7倍。而且XRCC1 194和399这两个位点的SNP存在联合作用,同时携带194 Arg/Trp和399 Arg/Arg基因型患者对铂类药物化疗的敏感性更高[12]。洪成雨等[13]研究结果显示,仅XRCC1 194基因多态与NSCLC患者铂类药物化疗的敏感性相关,而Arg399 Gln基因多态与化疗敏感性无关,而且XRCC1 194和399两个位点的SNP也无联合作用。姚成云[14]和赵万[15]的研究虽然证实了XRCC1 399基因多态与NSCLC患者铂类药物化疗敏感性相关,但其结果却显示,携带XRCC1 399 Gln突变基因患者的化疗反应率反而明显高于399 Arg/Arg野生型基因携带者。
表 1 PCR引物及扩增片段大小Tab 1 PCR primers and product sizes
表 2 XRCC1和XRCC3基因型与NSCLC化疗敏感性的关系Tab 2 The relationship between XRCC1 and XRCC3 genotypes and chemosensitivity of NSCLC
表 3 XRCC1 Arg194 Trp和Arg399 Gln多态联合与化疗疗效的关系Tab 3 Interaction of XRCC1 Arg194 Trp and XRCC1 Arg399 Gln polymorphisms on the chemotherapy response
表 4 XRCC1和XRCC3联合基因型与化疗疗效的关系Tab 4 Associations of XRCC1 and XRCC3 genotypes with the efficacy of chemotherapy
本研究结果表明,XRCC1 Arg194 Trp和Arg399 Gln两个位点的SNP均与NSCLC患者铂类药物的化疗敏感性密切相关。携带XRCC1 194 Trp纯合突变基因患者的化疗有效率是Arg/Arg野生型基因携带者的3.5倍(P=0.006)。携带至少1个Trp等位基因患者的化疗有效率至少是携带Arg/Arg基因型患者的2.5倍(P=0.018)。携带XRCC1 399 Arg/Arg野生型基因患者的化疗有效率明显高于其它基因型携带者。XRCC1 194和399两个位点基因多态之间在化疗敏感性方面存在明显的相互作用,携带至少1个XRCC1 194 Trp等位基因同时又携带XRCC1 399 Arg/Arg基因型患者的化疗有效率明显高于同时携带194 Arg/Arg和399 Arg/Gln基因型患者。本研究结果表明,携带XRCC1 194 Trp突变基因的患者对铂类药物化疗敏感,同时携带XRCC1 194 Trp突变基因和399 Arg/Arg野生型基因的患者对铂类药物化疗更敏感,而携带XRCC1 194 Arg/Arg野生型基因和399 Gln突变基因的患者对铂类药物化疗耐药。
许多研究报告了XRCC3 241 SNP与肺癌易感性的关联,但其研究结果却不尽相同,就目前的研究结果而言,尚无证据表明XRCC3 241多态性与中国人肺癌易感性相关[16,17]。而XRCC3 Thr241 Met的SNP与铂类药物化疗敏感性关系的研究较少,国内仅见任胜祥等[18]报告了ERCC1和XRCC3 241基因多态性在接受含铂方案化疗NSCLC中的疗效预测作用,其结果显示,130例晚期NSCLC患者中85.4%携带XRCC3 241 Thr/Thr基因型,16.4%携带Thr/Met或Met/Met基因型。XRCC3 241各基因型之间化疗有效率无统计学差异。本研究结果显示,在130例晚期NSCLC患者中,携带Thr/Thr和Thr/Met基因型患者分别为87.7%和12.3%,未检测到Met/Met纯合突变基因型。携带XRCC3 241 Thr/Thr和Thr/Met基因型者之间的化疗有效率无统计学差异。但XRCC1和XRCC3多态在化疗敏感性方面却存在明显的交互作用。
综上所述,本研究发现,XRCC1 194和399基因单核苷酸多态性均与晚期NSCLC患者铂类药物化疗敏感性密切相关,而XRCC3 241单核苷酸多态性与铂类药物化疗疗效无关。不仅XRCC1 194和399两个位点的基因多态具有联合作用,而且XRCC1与XRCC3两个基因多态在铂类药物化疗敏感性方面亦存在明显的交互作用。由此可见,XRCC1和XRCC3两个基因的多态性可能对临床化疗药物的选择具有指导意义。但由于本研究样本量较少,在应用于临床之前尚需扩大样本深入研究DNA碱基切除修复系统乃至整个DNA修复系统与铂类药物敏感性的关系,为肿瘤个体化治疗提供理论依据。