PubMed改版升级操作作用研究
2011-01-29史艳莉吕刚丽
史艳莉 路 娟 王 静 吕刚丽
PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的因特网生物医学信息检索系统,位于美国国立卫生研究院(NIH)的平台上。PubMed覆盖了全世界70多个国家4300多种主要生物医学期刊的摘要和部分全文。其覆盖的时间段也非常长,早的可以追溯到20世纪60年代。2009年PubMed的主界面由原有“一框五键”(检索框,Limit键, Preview/Index键, History键,Clipboard键和Details键)(如图1所示)改版为“一框三键”(检索框,Limit键, Advanced search键, Help键)(如图2所示)。现在PubMed的核心部分就是利用这“一框三键”功能完成文献信息资源的检索。
图1 “一框五键”式的检索界面
图2 “一框三键”式的检索界面
1 文献检索(基本检索、一框式)
在检索框中输入检索词,检索词(关键字)需做到:①明确要检索的关键字;②考虑到关键字的类似说法,即有可能出现的同义词;③通过限定DATES, Type of Article、languages等,精炼检索范围;④可使用布尔(BOOLEAN)运算,最常用的三种布尔运算即是AND,OR,和NOT。检索词确定并输入时,单击"Search"按钮或按回车键,PubMed将会自动开始检索,并将检索的相关条目显示在当前窗口中。在检索框上方,还可以选定所要检索内容的数据库范围,除NCBI的数据库以外,可供选择有PROTEIN, Nucleotide, Biosystem, Gene等。
图3 Limits键的选择范围
2 范围限制(Limit键)
单击Limits键进入范围限制界面(如图3所示)进行选项设定,Limit范围限制提供了9个功能,分别是:Dates、Type of Article、languages、species、Sex、Subsets、Ages、Test Options、Search Field Tags。提供的这些功能中,每一功能有多种选项,可供选择。
Limit功能将搜索范围设定从日期、年龄组、性别组、语种、人类或动物学范围,检索结果准确、效率高;如果搜索限定在某一特定的文章类型(如:临床试验、评论、荟萃分析、实践指引、随机对照试验、综述和更多出版物类型),在检索时设定搜索范围从全文链接、免费全文链接、摘要文献方面,缺省为所有域。使检索结果更精确、更与主题联系紧密,从而缩小的阅读文献量,提高的检索效率。Limit功能是PubMed数据库中的缩小器,同时也是PubMed数据库中的一特色。
3 高级检索(Advanced search键)
能使检索更为准确,高效,可以充分利用PubMed所提供的高级检索功能。在进入PubMed首页之后,在检索框的上方,有PubMed所提供的三个重要功能按钮其中之一,也是PubMed文献检索的精髓所在,即Advanced search键。高级检索主要依赖于基本检索,是以基本检索为基础,对基本检索可进行布尔(逻辑或与非)运算,同时把所限制的检索结果显示出来。但在这里需说明的是,基本检索中也可用布尔运算,与MeSH主题相同,布尔运算符需用大写字母,否则默认为首关键词。
PubMed数据库高级检索(Advanced search)界面是两框一列式(Search Box、Search Builder、Search History)。在检索框输入检索历史记录中的记录号(如:#2),记录号可手动录入或点击鼠标左键,有下拉菜单可选择,检索历史记录是基本检索时的结果,所提供的信息是时间和检出的结果总数,可进行了逻辑与或非运算,AND提供的运算方式不管输入的关键词语所出现的位置,结果都会出现在索引文献的某一处,就将其列出;而OR则是将出现至少一个关键词的文章列出,它将相似主题的文献罗列在一起;NOT运算可以在检索范围内将某些不需要的部分除去。但是在使用的时候要特别注意,会有可能将一些所需要的文献漏掉。对基本检索进行以上运算,而检索过程则成为了高级检索(检索式为:#2 AND #3 AND #4)(如图4所示),使得检索结果更贴近于检索主题,检索效率高,准确性强。
图4 高级检索的组配界面
图5 检索结果列表
图6 文摘式的检索所结果列表
通过PubMed数据库高级检索,检出的文献更接近于主题,并将显示于当前窗口(如图5所示),最初显示的是页面是:检索框处显示高级检索时的组配式,下面则是检出结果和显示页数及保存当前的检索式信息,和前方折叠按钮Display Setting(显示设置),单击按钮显示出文献的各种格式(概要、文摘、文本文摘等)、每页显示的条数、保存时选项(如图6所示)。需说明的是:Display Settingt和Send To是首尾呼应,并附有MeSH主题司信息。如所需文摘就激活文摘,使得文摘处于激活状态;选取每页显示条数为20,保存以当前检索的形式。而在显示类型的后面Send To按钮和Files your result(与文献相关信息),并对所检索的文献进行罗列,总数、评论及免费全文提供多少,当前处于哪一页,及下一页、最后一页的按钮。下方以次是Find related data 选择数据库,显示组配检索式,显示最近激活的文献数(基本检索结果)。检索结果的默认显示,标题、作者、出处、PMID号及有免费全文,编号在作者的前方。当激活显示类型中的文摘、20、当前检索时,检索界面变为所设定的。
在检索结果中选择相同或相类似的文献信息,点击标题处小方框,使处于选定状态,对选择的文献进行保存。保存(Send To)的方式有多种:①手动式:选取要保存的文献信息复制粘贴到记事本,而不在写字板或是WORD中,因为有链接;②自动式:单击Send To下拉菜单,有各种类型的:文件、剪切板、收集夹、目录、参考书目,发送到所选择的保存类型文件中,也可把文献资源直接导入Endnote中;③邮件式:以电子邮件的形式把所需的文献资源直接发送于邮箱。保存方式增多了,而更接近于网络及电子信息化处理,是2009版的突出特色,与以前版本的相比在保存方式上少了text选项,菜单上也少了很多,网页更加紧凑、页面整齐、功能增多并整合于一体,使页面简洁、条理清晰。
4 帮助功能(Help键)
帮助功能就是对上述操作出现问题、不理解或是不知道如何操作时起到说明解释或是如何操作及举例说明的。比改版之前有了更多的提示与说明,并都与各相关软件或是数据库相连,更是趋于网络资源信息化。
通过以上对2009年9月PubMed数据库界面及功能的改版,向检索者进行操作说明和功能的介绍,并在检索中过程中总结的经验与技巧,能更好的提高检索效率,缩短检索时间。
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